Simulacoes De Dinamica Molecular
Mostrando 1-12 de 112 artigos, teses e dissertações.
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1. Efeito da Taxa de Resfriamento na Liga Ni80Cu20 via Dinâmica Molecular
RESUMO A simulação em Dinâmica Molecular (MD) é uma poderosa ferramenta para estudo de ligas amorfas nanométricas. Neste artigo, a MD foi empregada para o estudo da liga Ni80Cu20. As simulações foram realizadas com o código livre LAMMPS, em um sistema contendo 2.000 átomos com interação atômica dada pelo potencial de Finnis-Sinclair (EAM-FS). O a
Matéria (Rio J.). Publicado em: 20/05/2019
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2. Differential Effect of Solution Conditions on the Conformation of the Actinoporins Sticholysin II and Equinatoxin II
Actinoporinas constituem uma família de proteínas formadoras de poros com atividade hemolítica. A base estrutural para tal atividade parece depender do seu enovelamento correto, especialmente em torno de algumas regiões funcionais, incluindo um sítio de ligação a fosfocolina, uma região rica em resíduos de triptofano e o amino-terminal. Adicionalmen
An. Acad. Bras. Ciênc.. Publicado em: 2014-12
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3. Purification and identification of metabolites produced by Bacillus cereus and B. subtilis active against Meloidogyne exigua, and their in silico interaction with a putative phosphoribosyltransferase fromM. incognita
Com o objetivo de contribuir para o desenvolvimento de produtos para o controle de Meloidogyne exigua, as bactérias Bacillus cereus e B. subtilis foram cultivadas em meio líquido de cultura para produzirem metabólitos ativos contra este nematoide parasita de plantas. Os fracionamentos dos extratos em diclorometano dos meios de cultura produziram uracila,
An. Acad. Bras. Ciênc.. Publicado em: 25/04/2014
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4. Simulações de líquidos super-resfriados via dinâmica molecular
This work presents the study of two models of glass-forming liquids using molecular dynamics simulations. The first model aims to analyze the effects on glassy dynamics which allow the enhancement of the glass formability on metallic glass formers. The Pd45Ni55 binary alloy and the Pd35Ni55Pt10 ternary one are modeled via the Embedded Atom method interaction
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 15/10/2012
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5. Caracterização bioquímica, biofísica e estrutural da Celobiohidrolase I de Trichoderma harzianum / Biochemical, biophysical and structural characterization of Cellobiohydrolase I from Trichoderma harzianum
Devido à sua importante atividade celulolítica, o fungo Trichoderma harzianum possui um grande potencial de aplicação na hidrólise da biomassa. No entanto, as celulases deste fungo filamentoso ainda não foram caracterizadas em profundidade. A celobiohidrolase I (CBHI) é a principal enzima celulolítica produzida por Trichoderma sp. e atualmente é uma
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 01/10/2012
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6. DINÂMICA MOLECULAR DA REAÇÃO DE ABSTRAÇÃO DE HIDROGÊNIO NO MH4 (M = C, Si, Ge, Sn) POR ÁTOMOS DE H, F, Cℓ E I INDUZIDA POR PULSO DE LASER DE FEMTOSEGUNDOS. / DYNAMICS OF MOLECULAR HYDROGEN ABSTRACTION REACTION IN MH4 (M = C, SI, GE, SN) IN THE ATOMS H, F, C ℓ EI PULSE INDUCED FEMTOSECOND LASER.
Neste trabalho foram realizadas simulações de dinâmica molecular quântica para as reações de abstração de hidrogênio nas moléculas de metano, silano, germano e estanano por átomos de H, F, Cl, e I sendo realizadas simulações sem e com o uso do pulso de laser de femtosegundos com o objetivo de favorecer a quebra das ligações M-H (M = C, Si, Ge
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 31/07/2012
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7. Computational strategies for monomers selection for the synthesis of molecularly imprinted polymers (MIPs) / Estratégias computacionais para escolha de monômeros para síntese de polímeros molecularmente impressos (MIPs)
Nesse estudo, investigamos, utilizando ferramentas computacionais, o problema do desenvolvimento racional de polímeros molecularmente impressos (MIP). Utilizamos vários tipos de simulações moleculares: dinâmica molecular, simulated annealing e método de Monte Carlo para alcançar uma seleção de monômeros funcionais baseada em uma biblioteca de monô
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 15/05/2012
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8. Estudo dinâmico conformacional da proteína calgranulina C (S100A12) mediante interação com íons e receptor RAGE / Dynamic and conformational study of protein calgranulin C (S100A12) in interaction with ions and RAGE receptor
Calgranulina C (S100A12) é membro da família das proteínas S100 \"EF-hands\" que complexam cálcio. A S100A12 humana é expressa predominantemente por granulócitos e é superexpressa em compartimentos inflamatórios. Níveis séricos elevados de S100A12 são encontrados em pacientes acometidos por distúrbios inflamatórios, neurodegenerativos, metabóli
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 03/05/2012
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9. Propriedades espectroscópicas do ácido orto-aminobenzóico: estudo computacional e experimental de efeitos de pH / Spectroscopic properties of the ortho-aminobenzoic acid: An computational and experimental study of the effects of pH.
A molécula de ácido orto-aminobenzóico tem sido intensamente empregada como sonda fluorescente no estudo de peptídeos e membranas e o entendimento dos efeitos de solvente sobre suas propriedades espectroscópicas apresenta grande interesse científico. Neste trabalho realizamos um estudo experimental e cálculos DFT sobre alterações nos espectros de ab
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 26/03/2012
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10. Um estudo sobre a predição da estrutura 3D aproximada de proteínas utilizando o método CReF com refinamento
Um dos principais desafios da Bioinformática Estrutural é entender como a informação decodificada em uma sequência linear de aminoácidos, ou estrutura primária de uma proteína, possibilita a formação de sua estrutura tridimensional. Muitos algoritmos buscam propor soluções para o problema complexo da classe NP-completo. Dentre eles, está o méto
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 22/03/2012
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11. Interactions between Activin-Like Kinase 5 (ALK5) receptor and its inhibitors and the construction of a Docking Descriptor-Based QSAR model
Neste estudo, simulações de dinâmica molecular (MD) e docking foram realizadas a fim de investigar o sítio de ligação e as interações de 61 inibidores com o receptor de kinase-5 do tipo ativina (ALK5). Uma simulação MD foi realizada sobre o receptor para obter sua conformação em água. A análise de docking revelou que interações do tipo ligaç
J. Braz. Chem. Soc.. Publicado em: 18/12/2012
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12. Molecular docking and molecular dynamic studies of semi-synthetic piperidine alkaloids as acetylcholinesterase inhibitors
A mistura dos derivados semissintéticos cloridrato da (-)-3-O-acetil-cassina e cloridrato da (-)-3-O-acetil-espectalina, preparada a partir da mistura dos alcalóides (-)-cassina e (-)-espectalina (4:1) obtida de Senna spectabilis, é um potente inibidor da acetilcolinesterase (AChE), assim justificando mais estudos moleculares. Neste sentido, estudos de do
Journal of the Brazilian Chemical Society. Publicado em: 2012-01