Genes de lignificaÃÃo em eucalyptus: estrutura e diversidade genÃtica dos genes 4cl e ccoaomt

AUTOR(ES)
DATA DE PUBLICAÇÃO

2005

RESUMO

O presente trabalho teve como objetivo o estudo da diversidade nucleotÃdica em dois genes chave na via de biossÃntese de lignina. Os genes 4cl e ccoaomt foram estudados em amostras de populaÃÃes naturais de trÃs espÃcies comerciais de eucalipto, E. grandis, E. globulus e E. urophylla. A mineraÃÃo de um banco de dados de ESTs gerado no projeto Genolyptus revelou a presenÃa de diferentes isoformas destes genes e uma riqueza de seqÃÃncias suficientes para detecÃÃo de SNPs. Para o gene 4cl, as tentativas de resseqÃenciamento sugeriram a existÃncia de vÃrias cÃpias do gene no genoma do eucalipto indicando a necessidade de clonagem prÃvia de amplicons para futuros estudos de diversidade de seqÃÃncia. A anÃlise de um trecho de 440 pb do gene ccoaomt revelou uma freqÃÃncia de 1 SNP a cada 55 pb, 63 pb e 220 pb respectivamente para E. grandis, E. urophylla e E. globulus. E. grandis (= 0,00356) apresentou o dobro de diversidade nucleotÃdica do que E. globulus (= 0,00168) e cerca de 1,4 vezes mais que E. urophylla (= 0,00254). Observa-se ainda que E. grandis, a espÃcie com a maior distribuiÃÃo geogrÃfica e portanto maior oportunidade de fluxo gÃnico, apresentou, de fato, valores mais altos de diversidade nucleotÃdica e haplotÃpica. SNPs fixados ou quase fixados bem como indel privativos foram observados em E. urophylla, a espÃcie disjunta que ocorre nas ilhas ao norte da AustrÃlia. Foram detectados polimorfismos nÃo sinÃnimos, potenciais alvos interessantes para estudos de variabilidade na atividade da enzima. A anÃlise da extensÃo do desequilÃbrio de ligaÃÃo, embora limitada a apenas um gene e com base em poucos sÃtios polimÃrficos, sugere que dentro de um gene e a distÃncias menores do que ~250 pb, SNPs tendem a se encontrar em forte desequilÃbrio de ligaÃÃo. O seqÃenciamento e montagem de um clone BAC resultaram na obtenÃÃo da seqÃÃncia completa da regiÃo codante do gene 4cl com 5.203 pb. A obtenÃÃo desta seqÃÃncia com o inÃcio de transcriÃÃo, inÃdita para Eucalyptus, abre possibilidades interessantes de estudos detalhados da diversidade nucleotÃdica e padrÃes de DL ao longo deste gene em populaÃÃes de clones fenotipados, no sentido de buscar associaÃÃes entre haplÃtipos especÃficos e variaÃÃo quantitativa em propriedades quÃmicas da madeira.

ASSUNTO(S)

ccoaomt nucleotide diversity bac 4cl genetica diversidade nucleotÃdica eucalyptus

ACESSO AO ARTIGO

Documentos Relacionados