Protein Structure Prediction
Mostrando 13-24 de 281 artigos, teses e dissertações.
-
13. In silico analysis of alpha1-antitrypsin variants: the effects of a novel mutation
Alpha1-antitrypsin (AAT) is a highly polymorphic protein with more than 120 variants that are classified as normal (normal protein secretion), deficient (reduced circulating AAT level caused by defective secretion) or null (no protein secretion). Alpha1-antitrypsin deficiency, one of the most common genetic disorders, predisposes adults to pulmonary emphysem
Genetics and Molecular Biology. Publicado em: 29/10/2010
-
14. Enhance the Van der Waals energy efficiency calculi in genetic algorithms for protein structure prediction / Aumento da eficiência do cálculo da energia de van der Waals em algoritmos genéticos para predição de estruturas de proteínas
Proteins are molecules present in the living organism and essential for their life. To understand the function of a protein, its threedimensional structure (the correct positions of all its atoms in the space) should be known. From the structure of a vital protein of an organism that causes a human disease, it is possible to develop medicines for treatment o
Publicado em: 2010
-
15. Algoritmos evolutivos e modelos simplificados de proteínas para predição de estruturas terciárias / Evolutionary algorithms and simplified models for tertiary protein structure prediction
A predição de estruturas de proteínas (Protein Structure Prediction PSP) é um problema computacionalmente complexo. Para tratar esse problema, modelos simplificados de proteínas, como o Modelo HP, têm sido empregados para representar as conformações e Algoritmos Evolutivos (AEs) são utilizados na busca por soluções adequadas para PSP. Entretanto,
Publicado em: 2010
-
16. Predição de regiões de interface proteina-proteina baseada em informações estruturais / Prediction of protein-protein interface region based on structural information
This work approaches the problem of protein-proteins interface region prediction based on measures of physical-chemical and structural properties. The approach considers the amino acids of the protein surface as the basic units for classification, such that the restriction of use of patches, considered by similar predictors, is eliminated. This predictor is
Publicado em: 2009
-
17. Prediction of binding hot spot residues by using structural and evolutionary parameters
In this work, we present a method for predicting hot spot residues by using a set of structural and evolutionary parameters. Unlike previous studies, we use a set of parameters which do not depend on the structure of the protein in complex, so that the predictor can also be used when the interface region is unknown. Despite the fact that no information conce
Genetics and Molecular Biology. Publicado em: 2009
-
18. Técnicas de controle da diversidade de populações em algoritmos genéticos para determinação de estruturas de proteínas / Control of the Population Diversity in Genetic Algorithms for the Determination of Protein Structures
Recentemente, pesquisadores têm proposto o uso de Algoritmos Genéticos (AGs) para a determinação da estrutura tridimensional de proteínas. No entanto, este é um problema difícil para um AG tradicional, pois na maioria das vezes ocorre a convergência prematura das soluções para ótimos locais. Isto ocorre porque o uso de mecanismos de seleção no A
Publicado em: 2009
-
19. Griscelli syndrome-type 2 in twin siblings: case report and update on RAB27A human mutations and gene structure
Griscelli syndrome (GS) is a rare autosomal recessive disorder caused by mutation in the MYO5A (GS1, Elejalde), RAB27A (GS2) or MLPH (GS3) genes. Typical features of all three subtypes of this disease include pigmentary dilution of the hair and skin and silvery-gray hair. Whereas the GS3 phenotype is restricted to the pigmentation dysfunction, GS1 patients a
Brazilian Journal of Medical and Biological Research. Publicado em: 2008-10
-
20. A new representation for the problem of prediction of the protein structure in lattices / Uma nova representação para o problema da estrutura de proteínas em grades
Encontrar a estrutura de uma proteína arbitrária é vital para a compreensão da funcionalidade desta proteína. Muitos modelos foram desenvolvidos para a predição em primeiros princípios, entre eles modelos de grades. Em modelos de grades, cada aminoácido ocupa uma posição da grade, com aminoácidos consecutivos ocupando posições adjacentes. Uma p
Publicado em: 2008
-
21. Algoritmos genéticos para predição ab initio de estrutura de proteínas / Genetic algorithms for AB INITIO protein structure prediction
Métodos de predição ab initio de estrutura de proteínas (PSP) buscam prever, baseando-se em primeiros princípios, a estrutura tridimensional que uma dada seqüência de aminoácidos irá adotar no espaço. Os métodos de predição ab initio atualmente possuem aplicações biotecnológicas que envolvem desde a criação de novas proteínas, o auxílio n
Publicado em: 2008
-
22. Utilização de máquinas de suporte vetorial para predição de estruturas terciárias de proteínas / Support vector machine for tertiary structure prediction
The three-dimensional structure of a protein is directly related to its function. Many projects of genetic sequence analysis accumulate a great number of protein sequences whose primary and secondary structures are known. However, the information on its three-dimensional structures are available only for a small fraction of these proteins. This fact evidence
Publicado em: 2007
-
23. AplicaÃÃo de sistemas imunolÃgicos artificiais para prediÃÃo da estrutura de proteÃnas / Artificial immune systems aplication for protein structure prediction
This work presents hybrid Immune-based Systems to solve the Protein Folding Problem for the three-dimensional hydrofobic-Polar model (3D HP). The Protein Structure Prediction consists of finding the spacial arrangement of a proteinâs amino acids that has a minimal energy. The proposed methodology is focused on Artificial Immune Systems supported by but uses
Publicado em: 2007
-
24. Multi-objective approach to protein tertiary structure prediction / Algoritmo híbrido multi-objetivo para predição de estrutura terciária de proteínas
Muitos problemas de otimização multi-objetivo utilizam os algoritmos evolutivos para encontrar as melhores soluções. Muitos desses algoritmos empregam as fronteiras de Pareto como estratégia para obter tais soluções. Entretando, conforme relatado na literatura, há a limitação da fronteira para problemas com até três objetivos, podendo tornar seu
Publicado em: 2007