Técnicas de controle da diversidade de populações em algoritmos genéticos para determinação de estruturas de proteínas / Control of the Population Diversity in Genetic Algorithms for the Determination of Protein Structures

AUTOR(ES)

Vinicius Tragante do Ó

DATA DE PUBLICAÇÃO

2009

RESUMO

Recentemente, pesquisadores têm proposto o uso de Algoritmos Genéticos (AGs) para a determinação da estrutura tridimensional de proteínas. No entanto, este é um problema difícil para um AG tradicional, pois na maioria das vezes ocorre a convergência prematura das soluções para ótimos locais. Isto ocorre porque o uso de mecanismos de seleção no AG acarreta uma perda da diversidade das soluções. Assim, neste trabalho, são investigadas estratégias para controlar a diversidade da população do AG e evitar que a solução fique rapidamente presa em ótimos locais. São empregadas bases de dados de ângulos de torção para a cadeia principal, cadeia lateral e técnicas de controle de diversidade em AGs conhecidas como Hipermutação e Imigrantes Aleatórios. Além disso, um novo algoritmo baseado no AG com Imigrantes Aleatórios Auto-Organizáveis é proposto. Os resultados mostram que estas variações são efetivas no objetivo de não manter o conjunto de soluções preso a uma região apenas, além de melhorar o desempenho para o problema de determinação de estruturas terciárias de proteínas.

ASSUNTO(S)

random immigrants algoritmos genéticos self-organization auto-organização genetic algorithms hipermutação estutura de proteínas protein structure prediction hypermutation imigrantes aletórios

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