Docagem
Mostrando 1-12 de 19 artigos, teses e dissertações.
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1. Structure-based drug design studies on a series of aldolase inhibitors
A tripanossomíase africana, também conhecida como doença do sono, é responsável por um grande número de mortes na África. Até o presente, não há tratamento seguro e eficaz disponível. A enzima aldolase do parasita Trypanosoma brucei é um alvo atrativo e validado para o desenvolvimento de novos fármacos. Uma série de ésteres fosfóricos foi est
J. Braz. Chem. Soc.. Publicado em: 2013-02
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2. Planejamento de inibidores das enzimas diidroorotato desidrogenase de Trypanosoma cruzi e Leishmania major / Design of inhibitors for dihydroorotate dehydrogenase from Trypanosoma cruzi and Leishmania major
Dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) catalyses the conversion of dihydroorote to orotate, the fourth step and only redox reaction in the de novo pyrimidine biosynthetic pathway. DHODH has been exploited as a validated target for therapy against proliferative and parasitic diseases, and in particular, has been considered to be an attractive target for drug de
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 25/04/2012
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3. Smart execution of molecular docking simulations of a fully-flexible receptor model
Simulações de docagem molecular com modelos de Receptores Totalmente Flexíveis (FFR) estão adquirindo maturidade. No entanto, isto demanda atividades computacionais de paralelização para geração e execução de grande volume de dados que precisam ser analizados. Computação multi-tarefa é um paradigma atrativo e que vem sendo aplicado frequentement
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 12/04/2012
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4. 3D-Tri : um algoritmo de indução de árvore de regressão para propriedades tridimensionais - um estudo sobre dados de docagem molecular considerando a flexibilidade do receptor
Com o avanço nos experimentos biológicos, a manipulação e análise do grande volume de dadossendo gerados por esses experimentos têm sido um dos desafios em bioinformática, onde umaimportante área de pesquisa é o desenho racional de fármacos (RDD - Rational Drug Desing). Ainteração entre macromoléculas biológicas, chamadas de receptores, e peque
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 17/01/2012
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5. Advanced QSAR studies on PPARδ ligands related to metabolic diseases
PPARδ é um receptor nuclear que, quando ativado, regula o metabolismo de carboidratos e lipídios, e está relacionado com diversas enfermidades, tais como síndrome metabólica e diabetes tipo 2. Para entender as principais interações entre alguns ligantes bioativos e o receptor PPARδ, modelos de QSAR 2D e 3D foram obtidos e comparados com mapas de pot
Journal of the Brazilian Chemical Society. Publicado em: 2012-01
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6. Planejamento de inibidores da cruzaína baseado em fragmentos / Fragment based drug design of cruzain inhibitors
A Doença de Chagas, descrita em 1909 pelo médico sanitarista brasileiro Dr. Carlos Chagas, é causada pelo parasito tripanossomatídeo Trypanosoma cruzi. Os tratamentos atuais consistem no uso dos fármacos benzonidazol e nifurtimox que são eficazes apenas no estágio inicial da doença (fase aguda), mas possuem efeitos colaterais severos. A enzima cruza�
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 27/07/2011
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7. Desenvolvimento de um filtro de descritores moleculares geométricos para gerar um ranqueamento em banco de dados de ligantes
Bancos de dados de ligantes de acesso público oferecem atualmente mais de 20 milhões ligantes para os usuários. Em contrapartida, a realização de testes in silico com esse elevado volume de dados é computacionalmente muito custoso, que vem demandar o desenvolvimento de novas soluções para a redução do número de ligantes a ser testado em seus recep
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 23/03/2011
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8. Planejamento de inibidores da enzima diidroorotato desidrogenase de Trypanosoma cruzi por biocalorimetria / Biocalorimetry as a tool for Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase inhibitors discovery
A doença de Chagas, causada pelo protozoário flagelado Trypanosoma cruzi, é uma doença tropical que enseja morte/morbidade de milhões de pessoas na América Latina. Por processos migratórios, vem-se estendendo ao sul dos Estados Unidos, Canadá, Europa, Austrália e Japão. Essa doença tem sido considerada super-negligenciada pela indústria farmacêu
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 04/03/2011
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9. Seleção eficiente de conformações de receptor flexível em simulações de docagem molecular
O desenvolvimento de fármacos é um dos grandes desafios da ciência atual por se tratar de um processo onde os custos e o tempo envolvido são elevados. Um dos problemas mais interessantes nessa área é a predição da conformação e da energia envolvida na interação entre ligantes e suas proteínas-alvo ou receptores. É nos experimentos de docagem mo
Publicado em: 2011
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10. A pipeline to study structural interactions among Spodoptera frugiperda serine proteinases and plant proteinase inhibitors.
We propose here a computational biology pipeline to identify and analyze possible structural determinants that could explain some level of insensitivity by S. frugiperda serine proteinases (SPs) against plant PIs observed in a real time PCR experiment.
CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA. Publicado em: 2011
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11. Estudos cristalográficos e aplicação da técnica de triagem virtual de ligantes para a busca de novos inibidores contra a enzima Citidina Deaminase (CDA; EC 3.5.4.5) de Mycobacterium tuberculosis H37Rv
A tuberculose tem sido um flagelo da humanidade desde os tempos antigos. Esta doença tem cobrado um preço alto em vidas humanas, por esta razão muitos esforços tem sido feitos com o intuito de derrotar o Mycobacterium tuberculosis. A sequência genômica do Mycobacterium tuberculosis deu início a uma nova era e foi de grande impacto para o presente conh
Publicado em: 2011
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12. Caracterização estrutural da interação de serino proteinases de Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae) e inibidores de proteinases de plantas / Structural characterisation of Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae) serine proteinase interactions with plant proteinase inhibitors.
As plantas desenvolveram diferentes mecanismos para reduzir o ataque de insetos, incluindo compostos protéicos de defesa, como os inibidores de proteinases (IPs). Os insetos, ao longo da evolução, desenvolveram estratégias para superar as barreiras defensivas das plantas, permitindo a sua alimentação e desenvolvimento, como a super expressão de genes
Publicado em: 2011