Characterization of the plasmid extracted pVCM 04 of Salmonella enterica isolated from chicken carcasses / Caracterização do plasmídeo pVCM 04 extraídos de Salmonella enterica isolada de carcaçãs de frangos
AUTOR(ES)
Lílian Carla Carneiro
DATA DE PUBLICAÇÃO
2010
RESUMO
Um pequeno plasmídeo críptico isolado de Salmonella enterica Enteretidis denominado pVCM04 foi sequênciado e caracterizado. O pVCM04 é uma molécula circular com 3583 pb a qual não apresenta homologia com outros plasmídeos depositados no GenBank. 12 ORF (Open Read Frame) com mais de 50 aminoácidos foram preditas usando o programa ORFinder. A ORF1 e a ORF2 apresentaram homologia com proteínas de replicação de diferentes plasmídeos. As ORF 3, 4 e 5 apresentaram homologia com proteínas de mobilização presente em vários plasmídeos; as outras sete ORF não apresentaram homologia com genes depositados no GenBank. O pVCM04 possui uma região, com mais de 500 pb, que não está associada a nenhuma das proteínas preditas. Esta região está organizada em uma sequência rica em G+C, A+T e duas sequências repetidas diretas. A segunda sequência repetida direta contém uma sequência de ligação para a proteína DnaA (TTTACAC). Esta região está provavelmente associada com a origem de replicação do tipo theta. As relações filogenéticas para as proteínas deduzidas replicase e de mobilização mostraram maior similaridade para proteínas replicase do que para proteínas de mobilização. Experimentos de conjugação evidenciaram que a fusão pVCM04⁄pUC18 não possui uma boa capacidade de transferência; o teste de estabilidade plasmidial demonstrou que as células perdem 60% do pVCM04⁄pUC18 no primeiro dia de cultivo. A caracterização do pVCM04 sugere que este plasmídeo provavelmente seja um plasmídeo críptico oriundo de diferentes ancestrais.
ASSUNTO(S)
plasmídeo plasmid conjugação 1.salmonella enterica 2.plasmídeo 3.salmonelose aviária biologia molecular salmonella enterica conjugation salmonella enterica
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