Predicao De Estrutura De Proteinas
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13. Ion-specific thermodynamical properties of aqueous proteins
Interações íon-específicas (dependentes do tipo de íon presente em solução) entre duas partículas coloidais são calculadas usando a equação de Poisson-Boltzmann (PB) modificada e simulações de Monte Carlo (MC). As equações de PB apresentam bons resultados de perfis de concentração nas proximidades de um macro-íon, principalmente para soluç
Anais da Academia Brasileira de Ciências. Publicado em: 2010-03
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14. Algoritmos evolutivos e modelos simplificados de proteínas para predição de estruturas terciárias / Evolutionary algorithms and simplified models for tertiary protein structure prediction
A predição de estruturas de proteínas (Protein Structure Prediction PSP) é um problema computacionalmente complexo. Para tratar esse problema, modelos simplificados de proteínas, como o Modelo HP, têm sido empregados para representar as conformações e Algoritmos Evolutivos (AEs) são utilizados na busca por soluções adequadas para PSP. Entretanto,
Publicado em: 2010
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15. Estudos estruturais de septinas: explorando interações entre subunidades de filamentos de septinas humanas / Structural studies of septins: exploring interactions between subunits of filaments of human septins
Septinas constituem uma família conservada de proteínas de citoesqueleto pertencentes à superclasse das P-loop GTPases. Tais proteínas estão envolvidas em vários processos celulares. Em humanos, algumas septinas também estão relacionadas a casos de patologia. Suas seqüências são divididas em três domínios: domínio N-terminal, domínio GTPase e
Publicado em: 2010
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16. Parâmetros físico-químicos na predição da atividade antioxidante de produtos naturais brasileiros
Espécies reativas de oxigênio (ROS) são capazes de oxidar proteínas celulares, ácidos nucléicos e lipídios; contribuindo para os processos de envelhecimento celular, mutações genéticas, doenças coronarianas, neoplásicas, degenerativas, dentre outras. Compostos fenólicos neutralizam a reatividade radicalar através da transferência de um elétro
Revista Brasileira de Farmacognosia. Publicado em: 2009-12
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17. Uma proposta para a predição computacional da estrutura 3D aproximada de polipeptídeos com redução do espaço conformacional utilizando análise de intervalos
As proteínas são polipeptídeos formados por uma longa cadeia covalente de resíduos de aminoácidos que, em condições fisiológicas (ambiente nativo), adota uma topologia 3D única. Estas macromoléculas estão envolvidas na maior parte das transformações moleculares nas células vivas. A estrutura nativa dita a função bioquímica específica da pro
Publicado em: 2008
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18. Algoritmos genéticos para predição ab initio de estrutura de proteínas / Genetic algorithms for AB INITIO protein structure prediction
Métodos de predição ab initio de estrutura de proteínas (PSP) buscam prever, baseando-se em primeiros princípios, a estrutura tridimensional que uma dada seqüência de aminoácidos irá adotar no espaço. Os métodos de predição ab initio atualmente possuem aplicações biotecnológicas que envolvem desde a criação de novas proteínas, o auxílio n
Publicado em: 2008
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19. A new representation for the problem of prediction of the protein structure in lattices / Uma nova representação para o problema da estrutura de proteínas em grades
Encontrar a estrutura de uma proteína arbitrária é vital para a compreensão da funcionalidade desta proteína. Muitos modelos foram desenvolvidos para a predição em primeiros princípios, entre eles modelos de grades. Em modelos de grades, cada aminoácido ocupa uma posição da grade, com aminoácidos consecutivos ocupando posições adjacentes. Uma p
Publicado em: 2008
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20. A hybrid intelligent system for prediction of position of the hydrogen atoms in proteins / Um sistema híbrido inteligente para previsão de posição de átomos de hidrogênio em proteínas
Os métodos existentes para a previsão da posição de átomos de hidrogênio em proteínas são todos baseados na simulação computacional de modelos construídos a partir de características físicas e (ou) químicas das moléculas. A abordagem proposta neste trabalho faz uso de técnicas inteligentes para a predição da posição de átomos de hidrogê
Publicado em: 2008
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21. Construção de Funções Empíricas Utilizando Rede Neural para Determinação de Constantes de Afinidade Receptor-Ligante / Construction of Empirical Scoring Functions Using Artificial Neural Network for Determination of Affinites Constants Between Receptor-Ligand
A compreensão dos mecanismos de reconhecimento molecular receptor-ligante é um dos aspectos centrais na descoberta e planejamento de novos fármacos baseado em estrutura. Uma metodologia chave é o atracamento de pequenas moléculas em sítios de ligação de proteínas, o atracamento molecular (em inglês, "molecular docking"). Existem dois pontos chaves
Publicado em: 2008
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22. Peptídeos virais imunogênicos como determinantes de reatividade cruzada no sistema imune
A identificação de epitopos e motivos virais para serem utilizados na imunização de humanos e animais é um objetivo importante e essencial em pesquisa imunológica. No momento, com novas ferramentas de bioinformática, diferentes abordagens são possíveis. A importância da bioinformática reside na possibilidade de trabalhar com grandes quantidades de
Publicado em: 2008
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23. Uma proposta para a predição computacional da estrutura terciária de polipeptídeos
Nos últimos anos, um dos grandes desafios da Ciência da Computação perante a Bioinformática é o desenvolvimento de algoritmos, os quais, em um tempo hábil, consigam gerar as estruturas terciárias de proteínas a partir da seqüência linear de seus aminoácidos. Embora existam alguns métodos que consigam gerar estruturas quando se possui outra prote
Publicado em: 2007
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24. Multi-objective approach to protein tertiary structure prediction / Algoritmo híbrido multi-objetivo para predição de estrutura terciária de proteínas
Muitos problemas de otimização multi-objetivo utilizam os algoritmos evolutivos para encontrar as melhores soluções. Muitos desses algoritmos empregam as fronteiras de Pareto como estratégia para obter tais soluções. Entretando, conforme relatado na literatura, há a limitação da fronteira para problemas com até três objetivos, podendo tornar seu
Publicado em: 2007