Enovelamento De Proteinas
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25. Generalized Simulated Annealing Parameter Sweeping Applied to the Protein Folding Problem / Mapeamento de Parâmetros do Simulated Annealing Generalizado aplicado ao problema do Enovelamento de Proteínas
Com os rápidos avanços no seqüenciamento do genoma, a compreensão da estrutura de proteínas torna-se uma extensão crucial a esses progressos. Apesar dos significativos avanços tecnológicos recentes, a determinação experimental da estrutura terciária de proteínas ainda é muito lenta se comparada com a taxa de acúmulo de dados das seqüências de
Publicado em: 2009
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26. Rastreamento de ESTs, expressão heteróloga de cDNAs e análise de proteases no estudo da interação patógeno-hospedeiro por paracoccidioides brasiliensis
Paracoccidioides brasiliensis é um fungo patogênico humano, agente etiológico da paracoccidioidomicose (PCM). P. brasiliensis apresenta dimorfismo térmico, apresentando-se sob a forma miceliana a temperaturas inferiores a 28 C e sob a forma leveduriforme no hospedeiro humano e em temperaturas superiores à 28 C. Proteases são enzimas que clivam proteín
Publicado em: 2009
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27. Caracterização funcional e estrutural de peroxidases dependentes de tiól da bactéria fitopatogênica Xylella fastidiosa / Functional and structural characterization of thiol-dependent peroxidases from the phytopathogenic bacterium Xylella fastidiosa
A bactéria fitopatogênica Xylella fastidiosa é o agente etiológico da Clorose Variegada dos Citros (CVC), que causa perdas anuais estimadas em US$ 100 milhões no Brasil. Durante o processo infeccioso, a geração extracelular de espécies ativas de oxigênio é um dos principais mecanismos de defesa da planta contra o patógeno. Em contrapartida, para s
Publicado em: 2009
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28. Dinâmica molecular de proteínas: estabilidade e renaturação / Protein Molecular Dynamics: stability and thermal renaturation
Proteínas são heteropolímeros lineares essenciais à vida, responsáveis pela estruturação dos organismos e pela maioria dos processos bioquímicos que os mantêm vivos e permitem sua reprodução. Essa variedade de funções é refletida na diversidade estrutural encontrada no universo das proteínas, já que sua função é intrinsecamente ligada à s
Publicado em: 2009
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29. Differential gene expression during Blastocladiella emersonii sporulation and analysis of the cyclic GMP signaling pathway / Expressão gênica diferencial durante a esporulação de Blastocladiella emersonii e estudo da sinalização por GMP cíclico
Neste trabalho realizamos a análise das variações na expressão gênica global durante a fase de esporulação do fungo aquático Blastocladiella emersonii utilizando a tecnologia dos microarranjos de cDNA em lâminas contendo 3.773 genes distintos. Ao todo 615 genes foram classificados como induzidos enquanto 645 foram classificados como reprimidos ao lo
Publicado em: 2009
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30. Estudos estruturais e dinamicos da proteina elicitora cerato-platanina / Structural and dynamics studies of the protein elicitor cerato-platanin
Um dos desafios que envolvem a patologia de plantas é determinar as bases moleculares que relacionam a patogenicidade do fungo na planta hospedeira. Em geral, o mecanismo pelo qual a planta se defende contra uma variedade de patógenos envolve o reconhecimento de moléculas específicas codificadas por esses microorganismos. A ceratoplatanina (CP) é uma pr
Publicado em: 2008
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31. Uma proposta para a predição computacional da estrutura 3D aproximada de polipeptídeos com redução do espaço conformacional utilizando análise de intervalos
As proteínas são polipeptídeos formados por uma longa cadeia covalente de resíduos de aminoácidos que, em condições fisiológicas (ambiente nativo), adota uma topologia 3D única. Estas macromoléculas estão envolvidas na maior parte das transformações moleculares nas células vivas. A estrutura nativa dita a função bioquímica específica da pro
Publicado em: 2008
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32. Estudos estruturais e funcionais das oxidoredutases de pontes dissulfeto da familia DsbA de Xylella fastidiosa / Structural and functional studies of the disulfide oxidorecdutases DsbA from Xylella fastidiosa
As oxidoredutases de pontes dissulfeto da família DsbA são responsáveis pela catálise da formação de pontes dissulfeto em proteínas secretadas para o periplasma, participando do processo de enovelamento de fatores de virulência de diversos organismos. É a proteína com maior potencial de oxidação atualmente caracterizada e tal propriedade é assoc
Publicado em: 2008
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33. Caracterização da relação entre estabilidade, estrutura e função de duas sHsps de cana-de-açucar e da Hsp40 da subfamilia A humana, chaperones envolvidos com o reconhecimento e apresentação de proteinas parcialmente enoveladas / Stability, strucure and function characterization of two sugarcane of two sugarcane sHsps and human subfamily Hsp40, chaperones involved with recognition of partially folded proteins
As proteínas estão envolvidas com as mais diversas funções biológicas. No entanto, para realizar sua função adequadamente, uma proteína deve estar enovelada, ou seja, em sua conformação nativa. Para garantir isso, existe nas células, um elaborado sistema que envolve chaperones moleculares, capaz de auxiliar na prevenção do enovelamento incorreto
Publicado em: 2007
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34. Molecular modeling and spectroscopic characterization of two proteins from Xylella fastidiosa potentially involved with phytopathogenicity / Modelagem molecular e caracterização espectroscopica de duas proteinas de Xylella fastidiosa potencilamente envolvidas com fitopatogenicidade
O fitopatogeno Xylella fastidiosa é uma bactéria limitada ao xilema que causa uma variedade de doenças economicamente importantes em plantas, incluindo uma doença chamada Clorose Variegada de Citrus (CVC). Recentemente, os dados de sequenciamento do DNA fornecidos pelo projeto genoma da Xylella fastidiosa permitiram uma aproximação da área genoma func
Publicado em: 2007
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35. Caracterização de seqüências expressas do genoma café potencialmente relacionadas com a resistência a doenças / Caracterization of expressed sequences from coffee genome potentially related with the resistance to diseases
Seqüências potencialmente envolvidas na resistência do cafeeiro a doenças foram identificadas, por meio de análise in silico, a partir das informações geradas pelo Projeto Brasileiro do Genoma Café (PBGC). Para isso foram usadas três estratégias. Inicialmente, palavras-chave correspondentes a termos relacionados aos mecanismos de resistência de pl
Publicado em: 2007
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36. Atomistic simulation of rare events using Transition Path Sampling / Simulações atomisticas de eventos raros atraves de Transition Path Sampling
Nesta dissertação abordamos o estudo de uma das limitações da simulação atomística denominada o evento raro, quem é responsável pela limitação temporal, exemplos de problemas que envolvem os eventos raros são, o enovelamento de proteínas, mudanças conformacionais de moléculas, reações químicas (em solução), difusão de sólidos e os proce
Publicado em: 2007