Métodos de RT-PCR e de hibridização Dot Blot para detecção universal de tospovirus
AUTOR(ES)
EIRAS, MARCELO, RESENDE, RENATO O., MISSIAGGIA, ALEXANDRE A., ÁVILA, ANTÔNIO C. DE
FONTE
Fitopatologia Brasileira
DATA DE PUBLICAÇÃO
2001-06
RESUMO
Visando a um método para a detecção universal de tospovírus, utilizaram-se as técnicas de "Transcriptase reverse - polymerase chain reaction" (RT-PCR) e hibridização com sondas marcadas com digoxigenina. As espécies de tospovirus testadas foram: Tomato spotted wilt virus, Tomato chlorotic spot virus, Groundnut ringspot virus, Chrysanthemum stem necrosis virus, Impatiens necrotic spot virus, Zucchini lethal chlorosis virus, Iris yellow spot virus. Os oligonucleotídeos foram sintetizados para anelar em regiões conservadas do genoma viral, sendo os produtos de PCR utilizados como sondas para hibridização através de "dot blot". Através de RT-PCR, utilizando-se diferentes combinações de oligonucleotídeos, somente foi possível a amplificação de todas as espécies quando se utilizou RNA de vírus purificado, sendo que, para a detecção a partir de RNA total, a RT-PCR apresentou problemas para a detecção das espécies ZLCV e IYSV. Sob condições de baixa adstringência, os testes de hibridização por "dot blot" com a sonda M (correspondente ao gene G1/G2) detectaram todas as espécies testadas, exceto IYSV. Com a sonda L, também sob condições de baixa adstringência, pôde-se detectar todas as espécies de tospovirus testadas simultaneamente em um único ensaio. Este método de detecção pode ser utilizado em serviços de quarentena e para indexação de germoplasma in vitro.
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