Integração de dados morfoagronômicos, moleculares e fitopatológicos para estabelecimento de coleção nuclear / Integration of morphoagronomical, molecular and phytopathological data for setting of core collection

AUTOR(ES)

Francielle Alline Martins

FONTE

IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia

DATA DE PUBLICAÇÃO

17/01/2011

RESUMO

Objetivou-se com este estudo realizar a integração de dados de caracteres quantitativos, multicategóricos, moleculares e fitopatológicos visando à avaliação da diversidade genética de subamostras de tomateiro do Banco de Germoplasma Hortaliças da Universidade Federal de Viçosa (BGH-UFV). Foi utilizado um conjunto de dados de 67 subamostras de tomateiro do BGH-UFV caracterizadas quanto a 27 caracteres quantitativos, 34 caracteres qualitativos, 144 locos ISSR, reação a Alternaria solani, Pseudomonas syringae pv. tomato e ao Tomato yellow spot vírus (ToYSV). A avaliação da diversidade genética entre as subamostras foi realizada para cada conjunto de caracteres por meio do agrupamento de Tocher e em seguida procedeu-se a comparação entre as matrizes de dissimilaridade obtidas a partir dos dados de diferentes naturezas pelo teste Z de Mantel. Embora os valores de correlação entre as matrizes tenham sido significativos a 5% probabilidade, esses foram de baixa magnitude, não oferecendo suporte para extrapolar os resultados de um conjunto de dados para outro. Assim, duas estratégias de integração dos dados foram utilizadas: CONV conversão dos dados quantitativos e fitopatológicos em multicategóricos, visando a obtenção de uma única matriz de dissimilaridade que contemplasse todas os caracteres independente de suas naturezas e a SOMA - obtenção das matrizes de dissimilaridade individualmente para cada conjunto de caracteres e em seguida a soma algébrica das mesmas. Dezessete subestratégias de conversão de dados foram analisadas, dentre essas destacou-se a DEA-3 (divisão equitativa da amplitude em três classes), cujo o valor de correlação com a matriz dissimilaridade original foi de 0,782. Ao comparar as estratégias CONV e SOMA observou-se alto valor de correlação, r=0,96, entre as matrizes de dissimilaridade obtidas por cada uma delas. No entanto, a estratégia CONV se destacou, uma vez que permitiu maior discriminação das subamostras. Foram estabelecidas 10 subcoleções a partir das 67 subamostras de tomateiro do BGH-UFV. Essas subcoleções foram definidas pela combinação entre a natureza dos dados avaliados e intensidade de amostragem. A estratégia de amostragem utilizada foi a logarítmica estratificada, e as subamostras selecionadas por estrato foram determinadas pela análise multivariada a partir do método de agrupamento de Tocher invertido. As intensidades avaliadas foram de 20 e 30%. Para a avaliação da representatividade das subcoleções estabelecidas e a definição da que melhor representou as subamostras de tomateiro do BGH-UFV foram realizadas comparações entre a coleção inicial e as subcoleções, considerando a variância e o índice de coincidência da amplitude. A análise gráfica da variabilidade foi realizada a partir do cálculo da frequência de subamostras representadas em cada classe das características quantitativas e multicategóricas, previamente convertidas em binárias, e características moleculares. Dentre as subcoleções, a 20% de intensidade, destacou-se a subcoleção baseada na integração de dados CONV-20, por possuir maiores índices de coincidência da amplitude acompanhados de valores de variância mais adequados. A 30% de intensidade, a subcoleção MOL-30 foi tão eficiente quanto as subcoleções baseadas na integração de dados, quando considerou-se apenas o índice de coincidência da amplitude e a média das variâncias. Entretanto, a análise gráfica da variabilidade mostrou uma ligeira superioridade da subcoleção CONV-30 em manter a variabilidade, principalmente em relação aos caracteres multicategóricos. Sempre que dados de diferentes naturezas estiverem disponíveis, deve-se priorizar o estabelecimento de coleções nucleares a partir da integração destes dados.

ASSUNTO(S)

melhoramento vegetal codificação de dados tomateiro diversidade genética data coding tomato genetic diversity

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