HeurÃstica de RegulaÃÃo CombinatÃria na ReconstruÃÃo de Redes de Genes / HeurÃstica de RegulaÃÃo CombinatÃria na ReconstruÃÃo de Redes de Genes
AUTOR(ES)
Fabio Fernandes da Rocha Vicente
DATA DE PUBLICAÇÃO
2006
RESUMO
Um dos principais objetivos da biologia molecular à descobrir o funcionamento de redes complexas de interaÃÃo entre elementos celulares. Nas Ãltimas dÃcadas um grande volume de dados biolÃgicos vem sendo produzido assim como modelos computacionais que fazem uso destes dados. Os mÃtodos computacionais para ReconstruÃÃo de Redes de Genes apresentam-se como uma ferramenta importante para auxiliar no estudo e entendimento desta complexidade. Este trabalho apresenta uma proposta para ReconstruÃÃo de Redes de Genes que utiliza-se de diferentes fontes de dados e incorpora conhecimento biolÃgico com o objetivo de melhorar a qualidade da inferÃncia. Comparou-se a abordagem proposta com um trabalho anterior. Foram realizados experimentos com dados artificiais e dados reais de S. cerevisiae. O modelo proposto apresentou melhores resultados que o anterior em todos os critÃrios de avaliaÃÃo para experimentos com dados artificiais. Na avaliaÃÃo com dados reais a nova abordagem apresentou uma pequena melhora em apenas uma das configuraÃÃes testadas
ASSUNTO(S)
combinatorial regulation redes bayesianas regulaÃÃo combinatÃria bayesian networks heuristic consensus motif heurÃstica redes de genes microarray consensus motif microarray ciencia da computacao gene network
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