Ensaio de PCR alelo-específico para genotipar o SNP rs7903146 no gene TCF7L2 para rápida triagem de suscetibilidade ao diabetes

Dutra, Ludmila Alves Sanches, Costa, Patrícia Godoy Garcia, Velasco, Lara Franciele Ribeiro, Amato, Angélica Amorim, Barra, Gustavo Barcelos

Ensaio de PCR alelo-específico para genotipar o SNP rs7903146 no gene TCF7L2 para rápida triagem de suscetibilidade ao diabetes

AUTOR(ES)

Dutra, Ludmila Alves Sanches, Costa, Patrícia Godoy Garcia, Velasco, Lara Franciele Ribeiro, Amato, Angélica Amorim, Barra, Gustavo Barcelos

FONTE

Arquivos Brasileiros de Endocrinologia & Metabologia

DATA DE PUBLICAÇÃO

2008-11

RESUMO

OBJETIVO: O objetivo deste estudo foi validar um método de PCR alelo-específico, rápido e simples, para genotipagem do polimorfismo rs7903146 (C/T) no gene TCF7/L2 utilizando equipamentos convencionais. MÉTODOS: Dois primers forward com variações nos seus nucleotídeos 3' foram desenhados de forma que cada um fosse específico para uma das variantes. Eles foram combinados com um primer reverso comum em duas reações de PCR. A amplificação de tamanho específico indica a presença do alelo. Cento e quatro amostras de DNA foram genotipadas por esse método. Para validar o ensaio, uma amostragem representativa dos três possíveis genótipos (63 amostras) teve a região contendo o polimorfismo seqüenciada. RESULTADOS: A genotipagem do polimorfismo rs7903146 derivada da PCR alelo-específica estava em completa concordância com o sequenciamento. CONCLUSÕES: O ensaio aqui descrito é uma estratégia adequada para a genotipagem do polimorfismo rs7903146 (C/T) do gene TCF7/L2 e permite identificação alélica rápida e precisa.

ASSUNTO(S)

diabetes tipo 2 tcf7/l2 snp rs7903146