Avaliação de quatro estratégias diferentes para caracterizar proteínas da membrana plasmática de raízes de banana

AUTOR(ES)

Garcia, Suzana Antunes Lourençoni, Panis, Bart, Swennen, Rony, Carpentier, Sebastien Christian

FONTE

Ciênc. agrotec.

DATA DE PUBLICAÇÃO

2014-10

RESUMO

Proteínas da membrana plasmática constituem uma importante classe de proteínas. Elas estão envolvidas na transmissão de sinais externos para o interior da célula e no transporte seletivo de nutrientes/ions, através da membrana plasmática. Porém, o estudo dessas proteinas é difícil, porque elas são poucoabundantes e apresentam baixa solubilidade em tampões aquosos. Neste trabalho, nós avaliamos quatro estratégias diferentes para extrair proteínas da membrana plasmática de raízes de banana: (i) a técnica de sistema aquoso de duas fases, constituída porpolímeros(ATPS) combinada com eletroforese em gel e (ii) ATPS sem gel usandoLC-MS/MS, (iii) uma fração microssomal e (iv) uma fração, contendo o proteoma total celular, ambas as frações avaliadas via LC-MS/MS. Nossos resultados mostram que a estratégia baseada em eletroforese em gel é útil para a visualização de proteínas, mas apresenta limitações em termos de reproducibilidade e eficiência. Dentre as estratégias sem o uso de gel, a fração microssomal permitiu a identificação do maior número de proteínas de membrana plasmática, seguida pela fração de proteoma total e pela técnica de sistema aquoso de duasfases. O alto rendimento de proteínas de membrana plasmática proporcionado pela fração microssomal pode ser explicado pelo enriquecimento de proteínas de membrana nessa fração e pela eficiência do espectrômetro de massa na identificação de proteínas.

ASSUNTO(S)

sistema aquoso de duas fases frações microssomal e de proteoma total identificação de proteínas

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