Dinamica Molecular
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13. Structure-based drug design studies on a series of aldolase inhibitors
A tripanossomíase africana, também conhecida como doença do sono, é responsável por um grande número de mortes na África. Até o presente, não há tratamento seguro e eficaz disponível. A enzima aldolase do parasita Trypanosoma brucei é um alvo atrativo e validado para o desenvolvimento de novos fármacos. Uma série de ésteres fosfóricos foi est
J. Braz. Chem. Soc.. Publicado em: 2013-02
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14. Estudo do efeito isotópico sobre a solubilidade da 3- metilpiridina em H2O e D2O / The isotopic effect on organic molecules solubility in H2O and D2O
Experimental studies of 3-methylpiridyne/water and 3- methylpiridyne/heavy water binary mixtures show solubility differences. In this work Molecular Dynamics method was used to simulate 54 model systems. Each system corresponds to a point at a temperature vs molar fractions phase diagram. The systems were simulated in cubic boxes containing a mixture of 3- m
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 07/12/2012
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15. Simulações de líquidos super-resfriados via dinâmica molecular
This work presents the study of two models of glass-forming liquids using molecular dynamics simulations. The first model aims to analyze the effects on glassy dynamics which allow the enhancement of the glass formability on metallic glass formers. The Pd45Ni55 binary alloy and the Pd35Ni55Pt10 ternary one are modeled via the Embedded Atom method interaction
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 15/10/2012
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16. Caracterização bioquímica, biofísica e estrutural da Celobiohidrolase I de Trichoderma harzianum / Biochemical, biophysical and structural characterization of Cellobiohydrolase I from Trichoderma harzianum
Devido à sua importante atividade celulolítica, o fungo Trichoderma harzianum possui um grande potencial de aplicação na hidrólise da biomassa. No entanto, as celulases deste fungo filamentoso ainda não foram caracterizadas em profundidade. A celobiohidrolase I (CBHI) é a principal enzima celulolítica produzida por Trichoderma sp. e atualmente é uma
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 01/10/2012
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17. Análise e caracterização molecular, estrutural e populacional de proteases de HIV-1 do Estado de São Paulo. / Molecular, structural and populational analysis and characterization of HIV-1 proteases at Sao Paulo state.
Apesar dos esforços para controlar a infecção por HIV-1, na América do Sul, diversos recombinantes tem sido descritos, principalmente entre os subtipos B e F. Durante a tarefa coordenada de HIV-1 VGDN, foram encontrados diversos novos recombinantes BF no estado de São Paulo, sendo a maioria deles com a protease F. Técnicas filogenéticas usadas em inte
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 14/08/2012
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18. Transporte eletrônico em sistemas semicondutores orgânicos emissores de luz
Nesse texto, as propriedades estruturais e eletrônicas de compostos semicondutores orgânicos derivados de calcogenofeno-dialcóxifenileno são estudadas por Teoria do Funcional da Densidade com correções semi-empíricas. A estrutura eletro-óptica dos compostos cujo calcogênio varia entre Enxofre, Selênio e Telúrio é determinada para duas arquitetura
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 06/08/2012
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19. DINÂMICA MOLECULAR DA REAÇÃO DE ABSTRAÇÃO DE HIDROGÊNIO NO MH4 (M = C, Si, Ge, Sn) POR ÁTOMOS DE H, F, Cℓ E I INDUZIDA POR PULSO DE LASER DE FEMTOSEGUNDOS. / DYNAMICS OF MOLECULAR HYDROGEN ABSTRACTION REACTION IN MH4 (M = C, SI, GE, SN) IN THE ATOMS H, F, C ℓ EI PULSE INDUCED FEMTOSECOND LASER.
Neste trabalho foram realizadas simulações de dinâmica molecular quântica para as reações de abstração de hidrogênio nas moléculas de metano, silano, germano e estanano por átomos de H, F, Cl, e I sendo realizadas simulações sem e com o uso do pulso de laser de femtosegundos com o objetivo de favorecer a quebra das ligações M-H (M = C, Si, Ge
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 31/07/2012
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20. Computational strategies for monomers selection for the synthesis of molecularly imprinted polymers (MIPs) / Estratégias computacionais para escolha de monômeros para síntese de polímeros molecularmente impressos (MIPs)
Nesse estudo, investigamos, utilizando ferramentas computacionais, o problema do desenvolvimento racional de polímeros molecularmente impressos (MIP). Utilizamos vários tipos de simulações moleculares: dinâmica molecular, simulated annealing e método de Monte Carlo para alcançar uma seleção de monômeros funcionais baseada em uma biblioteca de monô
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 15/05/2012
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21. Estudo dinâmico conformacional da proteína calgranulina C (S100A12) mediante interação com íons e receptor RAGE / Dynamic and conformational study of protein calgranulin C (S100A12) in interaction with ions and RAGE receptor
Calgranulina C (S100A12) é membro da família das proteínas S100 \"EF-hands\" que complexam cálcio. A S100A12 humana é expressa predominantemente por granulócitos e é superexpressa em compartimentos inflamatórios. Níveis séricos elevados de S100A12 são encontrados em pacientes acometidos por distúrbios inflamatórios, neurodegenerativos, metabóli
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 03/05/2012
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22. Simulação da dinâmica do estado excitado em semicondutores orgânicos / Simulation of the excited state dynamics in organic semiconductors
In the present work, the Monte Carlo method and the direct numerical integration of the Master Equation were employed to simulate the excitation spectral diffusion process in light emitting polymeric systems. The methodology employed a competition among the internal intra-molecular relaxation, the inter-molecular incoherent energy transfer via Förster mecha
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 25/04/2012
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23. Planejamento de inibidores baseado em fragmentos moleculares para a enzima gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase de Trypanosoma cruzi / Design of inhibitors through fragment-based drug discovery for the enzyme glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase from Trypanosoma cruzi
Chagas disease is a parasitic illness endemic in Latin America caused by the trypanosomatid parasite Trypanosoma cruzi that spreads around the world due to people migration. Nowadays, Benznidazole and Nifurtimox (banned in Brazil), are used for the treatment of this disease but causes severe side effects to patients. Recently, three new molecules have reache
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 20/04/2012
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24. Ensino de química para alunos cegos : desafios no ensino médio
A utilização de modelos no Ensino de Química vem atrelando o entendimento de vários conteúdos, tais como representação molecular, funções químicas, estequiometria, dentre outros, à significação visual. Esses conhecimentos tornam-se importantes para que haja uma formação crítica e consciente do aluno em relação à utilização das substânci
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 19/04/2012