Boolean Networks
Mostrando 1-12 de 15 artigos, teses e dissertações.
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1. Boolean Operators to Improve Multi-Objective Evolutionary Algorithms for Designing Optical Networks
Abstract The physical topology design (PTD) of optical networks is frequently accomplished by combining several solutions in an iterative way, especially if meta-heuristics are deployed for this purpose. Suitable operators to recombine information of network topologies aiming at creating innovative options for designing networks are very useful. Operators th
J. Microw. Optoelectron. Electromagn. Appl.. Publicado em: 2016-12
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2. Dinâmica da Fermentação Alcóolica: Aplicação de Redes Booleanas na Dinâmica de Expressão Gênica em Linhagens de Saccharomyces Cerevisiae durante o Processo Fermentativo / Dynamics of alcoholic fermentation: application of Boolean networks in the dynamics of gene expression in Saccharomyces cerevisiae strains during fermentation process
Na busca por soluções que maximizem a produção de etanol, o melhoramento genético de diferentes linhagens de levedura tornou-se foco de investigação em diversos centros de pesquisa. Com o recente sequenciamento de uma linhagem selvagem utilizada nas usinas sucroalcooleiras brasileiras, a linhagem PE-2 da espécie Saccharomyces cerevisiae, surgiu o int
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 17/10/2012
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3. Interações gênicas usando redes booleanas limiarizadas modeladas como um problema de satisfação de restrições / Gene interactions using thresholded boolean networks modeled as a constraint satsfaction problem
As reações químicas que resultam da expressão de genes são complexas e ainda não são total- mente compreendidas. Sabe-se que os genes enviam, recebem, e processam informações formando uma complexa rede de comunicação, mas a arquitetura e dinâmica destas redes não são totalmente conhecidas. Dessa forma, um problema importante é determinar como
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 03/04/2012
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4. Inference of gene regulatory networks using the seed growing paradigm / Inferência de redes de regulação gênica utilizando o paradigma de crescimento de sementes
Um problema importante na área de Biologia Sistêmica é o de inferência de redes de regulação gênica. Os avanços científicos e tecnológicos nos permitem analisar a expressão gênica de milhares de genes simultaneamente. Por \"expressão gênica\ \ , estamos nos referindo ao nível de mRNA dentro de uma célula. Devido a esta grande quantidade de da
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 17/02/2012
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5. Automatic generation and evaluation of transistor networks in different logic styles / Geração automática e avaliação de redes de transistores em diferentes estilos lógicos
Currently, VLSI design has established a dominant role in the electronics industry. Automated tools have enabled designers to manipulate more transistors on a design project and shorten the design cycle. In particular, logic synthesis tools have contributed significantly to reduce the design cycle time. In full-custom designs, manual generation of transistor
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 2008
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6. Exploração de reordenamento de ROBDDs no mapeamento tecnológico de circuitos integrados / Exploration of ROBDD reordering on technology mapping for integrated circuits
The ROBDDs are structures that have been successfully used in CAD tools for microelectronics. These structures allow canonical representation of boolean functions when established a fixed variable ordering. In the context of an automatic logic cell generator for integrated circuits, ROBDDs may serve as a base for deriving transistor networks from which elect
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 2007
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7. Randon Boolean networks in the presence of a damaging agent / DinÃmica de redes Booleanas aleatÃrias na presenÃa de agente danificador.
NÃs realizamos simulaÃÃes de computador em autÃmatos de Kauffman em diversos grafos tais como redes quadradas regulares e agregados de percolaÃÃo invasiva afim de investigar transiÃÃes de fase, entropia total, distribuiÃÃo radial do dano total mÃdio (expoente dinÃmico $z$) e velocidade de propagaÃÃo do dano quando se introduz um agente danifica
Publicado em: 2007
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8. Redes bayesianas para inferÃncia de redes regulatÃrias de genes
With the development of functional genomics, data on a great number of species are being obtained in huge volumes. Technologies to measure the differences of the gene expression, through mRNA concentration (microarray), have become extremely popular, and their costs are decreasing. The reconstruction of genetic networks from gene expression data to study the
Publicado em: 2005
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9. Random Boolean network models and the yeast transcriptional network
The recently measured yeast transcriptional network is analyzed in terms of simplified Boolean network models, with the aim of determining feasible rule structures, given the requirement of stable solutions of the generated Boolean networks. We find that, for ensembles of generated models, those with canalyzing Boolean rules are remarkably stable, whereas th
National Academy of Sciences.
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10. The role of certain Post classes in Boolean network models of genetic networks
A topic of great interest and debate concerns the source of order and remarkable robustness observed in genetic regulatory networks. The study of the generic properties of Boolean networks has proven to be useful for gaining insight into such phenomena. The main focus, as regards ordered behavior in networks, has been on canalizing functions, internal homoge
National Academy of Sciences.
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11. Genetic networks with canalyzing Boolean rules are always stable
We determine stability and attractor properties of random Boolean genetic network models with canalyzing rules for a variety of architectures. For all power law, exponential, and flat in-degree distributions, we find that the networks are dynamically stable. Furthermore, for architectures with few inputs per node, the dynamics of the networks is close to cri
National Academy of Sciences.
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12. Gene-Gene Cooperativity in Small Networks
We show how to construct a reduced description of interacting genes in noisy, small regulatory networks using coupled binary spin variables. Treating both the protein number and gene expression state variables stochastically and on equal footing, we propose a mapping that connects the molecular level description of networks to the binary representation. We c
The Biophysical Society.