Triplet entropy in H1N1 virus

AUTOR(ES)
FONTE

TEMA (São Carlos)

DATA DE PUBLICAÇÃO

2011-12

RESUMO

Neste trabalho analisamos a entropia de tripletes em um conjunto de sequências do vírus H1N1. Correlacionamos medidas de entropia com concentração de Guanina-Citosina para um conjunto de mais de 30.000 sequências, controlando a cronologia dessas sequencias. Esta abordagem permitiu traçar um mapa das mudanças organizacionais vírus ao longo do século XX. A principal conclusão da análise foi mostrar que alguns segmentos do vírus estão apresentando mutação com uma taxa mais elevada do que outros ao longo dos anos e, em alguns casos, as sequências tendem a se glomerar, formando novos subgrupos. A maior taxa de mutação foi encontrada precisamente nos segmentos PA e PB1, que são parte da maquinária de replicação do H1N1. Isto evidencia que medidas organizacionais, como essas aqui apresentadas, parecem refletir parcialmente a dinâmica dos segmentos e corroboram alguns resultados experimentais recentes, os quais mostram, entre outras coisas, que durante o último surto do vírus tem havido grandes mudanças precisamente na atividade da polimerase. Este tipo de abordagem pode ajudar na escolha dos melhores alvos visando o ratamento dessa doença.

ASSUNTO(S)

h1n1 entropia dna

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