The influence of GC/AT composition on intercalating and semi-intercalating binding of ethidium bromide to DNA

AUTOR(ES)

Vardevanyan, Poghos O., Antonyan, Ara P., Parsadanyan, Marine A., Shahinyan, Mariam A., Hambardzumyan, Lilit A., Torosyan, Margarita A., Karapetian, Armen T.

FONTE

J. Braz. Chem. Soc.

DATA DE PUBLICAÇÃO

11/12/2012

RESUMO

Os parâmetros de ligação de brometo de etídio (EtBr) com DNA em diversas proporções GC/AT foram determinados usando espectroscopia de absorção e fluorescência. Nossos dados experimentais demonstram claramente a co-existência de tipos de ligação "forte" fluorescente e não-fluorescente em baixas concentrações de EtBr. O complexo fluorescente corresponde ao modelo normal intercalante. O complexo não-fluorescente refere-se à ligação semi-intercalante de EtBr. A constante de ligação (K) e o número de pares de bases correspondentes ao sítio de ligação (n) dos tipos fluorescente (Kf e n f) e não-fluorescente (Knf, n nf) de interações foram determinados. O tamanho médio do sítio de ligação (n) é igual a 1,5 bp (espectroscopia de absorção), e n f ca. 2 bp (espectroscopia de fluorescência). Mostrou-se que n nf é dependente da quantidade de GC e n total é independente.

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