Rule extraction from artificial neural networks applied to the problem of protein secondary structure prediction / Extração de regras de redes neurais artificiais aplicadas ao problema da determinação da estrutura secundária de proteínas

AUTOR(ES)
DATA DE PUBLICAÇÃO

2004

RESUMO

Extração de Regras de Redes Neurais Artificiais Aplicadas ao Problema da Previsão da Estrutura Secundária de Proteínas apresenta o estudo feito sobre a extração de conhecimento de Redes Neurais na forma de regras difusas. Na aplicação desta técnica, foi utilizado o problema da classificação da estrutura secundária de proteínas, em alfa, beta e coil, a partir da estrutura primária. Serão apresentadas as implementações feitas para viabilizar esta tarefa. Dentre elas: a implementação de recursos adicionais ao software de extração de regras; a definição de uma metodologia de extração de regras; a implementação desta metodologia; e a análise das regras extraídas. Dentre os recursos implementados no processo de extração, sra visto que o foco principal foi o de embasar o conhecimento extraído sobre um suporte estático e disponibilizar medidas complementares para sua avaliação. Na definição da metodologia, será visto que cuidados devem ser tomados na preparação da base de dados e na definição da estrutura da rede. Cuidados que foram seguidos e devidamente apresentados na fase da implementação. Será visto que a implementação da metodologia e a análise das regras procurou validar qualitativamente o processo, comparando o conhecimento extraído com um já existente bem como fornecendo um novo. Neste processo, foi utilizada a abordagem tradicional de codificação ortogonal dos resíduos e uma proposta de utilização de atributos físico-químicos ( i.e ponto isoelétrico e índice hidropático) considerados válidos e importantes o contexto. Por fim, espera-se que o conhecimento disponibilizado seja analisado por profissionais de competência para tal, visando fomentar a discussão sobre a sai validade e do processo pelo qual foram geradas. E que o retorno da análise sirva para o aprimoramento da técnica utilizada.

ASSUNTO(S)

dobramento de proteínas redes neurais inteligência artificial data minning regras de redes ciencia da computacao artificial neural network rule extraction data minning protein folding extração de regras rede neural artificial

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