Plant-Based Microarray Data at the European Bioinformatics Institute. Introducing AtMIAMExpress, a Submission Tool for Arabidopsis Gene Expression Data to ArrayExpress

AUTOR(ES)
FONTE

American Society of Plant Biologists

RESUMO

ArrayExpress is a public microarray repository founded on the Minimum Information About a Microarray Experiment (MIAME) principles that stores MIAME-compliant gene expression data. Plant-based data sets represent approximately one-quarter of the experiments in ArrayExpress. The majority are based on Arabidopsis (Arabidopsis thaliana); however, there are other data sets based on Triticum aestivum, Hordeum vulgare, and Populus subsp. AtMIAMExpress is an open-source Web-based software application for the submission of Arabidopsis-based microarray data to ArrayExpress. AtMIAMExpress exports data in MAGE-ML format for upload to any MAGE-ML-compliant application, such as J-Express and ArrayExpress. It was designed as a tool for users with minimal bioinformatics expertise, has comprehensive help and user support, and represents a simple solution to meeting the MIAME guidelines for the Arabidopsis community. Plant data are queryable both in ArrayExpress and in the Data Warehouse databases, which support queries based on gene-centric and sample-centric annotation. The AtMIAMExpress submission tool is available at http://www.ebi.ac.uk/at-miamexpress/. The software is open source and is available from http://sourceforge.net/projects/miamexpress/. For information, contact [email protected]

Documentos Relacionados

Se o seu (des)orientador pediu para você fazer os Resultados e Discussão no TCC, mas não te explicou o que é isso e nem mostrou Como Fazer, este artigo é para você! Você quer Aprender Definitivamente O Que São e Como Fazer os Resultados e Discussão no seu TCC, não quer? Então, você tem que dar uma olhada no VÍDEO deste artigo. Aprenda de maneira Rápida e Definitiva Como Fazer os Resultados e Discussão no TCC, com exemplos Simples e Objetivos para trabalhos com Pesquisa de Campo Ler artigo

Você sabe o que escrever na introdução do seu TCC? Você já parou na frente do seu computador sem ter a menor ideia sobre a introdução do seu TCC, o que escrever e por onde começar? Eu já passei por isso. E como eu não desejo essa situação para ninguém, é hora de resolver esse problema. Muita gente, mas muita gente mesmo me pergunta: “Amilton, o que eu devo escrever na Introdução do meu TCC?” Aí vai a resposta: A Introdução do seu TCC é Ler artigo

Como fazer TCC? Nas últimas semanas tenho visto milhares de alunos com dificuldades, sem saber o que fazer, que simplesmente ficam parados na frente do computador e não conseguem escrever uma única palavra sequer. Neste texto, nós vamos ver como mudar essa situação de uma vez por todas! Alguns alunos me mandam e-mails perguntando Como Fazer TCC passo a passo. Bom, em primeiro lugar, essa é uma dificuldade muito comum, vivida por 99,9% dos alunos de faculdades no Brasil e no mundo! Os outros 0,01% Ler artigo

TCC Pronto e Gratuito? Sério mesmo? Você acredita em almoço de graça? Comprar um TCC Pronto? Fazer o Próprio TCC? Você ainda tem dúvidas como essas? Você PRECISA ver este Artigo com Urgência! Neste artigo você encontrará: TCC Pronto e Gratuito Comprar TCC Pronto É só me corrigir se eu estiver errado, mas as pessoas Adoram Atalhos, certo? O problema é que, muitas vezes, ATALHOS São ARMADILHAS DISFARÇADAS. Então, se você quer Fugir das Armadilhas e quer saber a Verdade sobre TCC Pronto, TCC Pronto e Ler artigo

Se você quer aprender Como Fazer Citações para o TCC de forma fácil e não ser acusado de plágio, então, recomendo fortemente que leia esse artigo até o final… E não se esqueça de assistir o vídeo logo abaixo! Imagina só… você fez todo o seu TCC, está aliviado, radiante, tirou um peso das costas… aí, PAH! Seu orientador diz que o seu trabalho tem Plágio e, por isso, vai ser reprovado. Não!!!! Aí vai uma notícia que talvez você não saiba, SE VOCÊ FEZ Ler artigo