Patterns of expression of cell wall related genes in sugarcane

AUTOR(ES)
FONTE

Genetics and Molecular Biology

DATA DE PUBLICAÇÃO

2001-12

RESUMO

A busca por genes relacionados ao metabolismo da parede celular no banco de dados SUCEST-FAPESP resultou em 459 potenciais genes ("clusters") que correspondem a 3283 clones ("reads"), o que corresponde a cerca de 1.1% do número total de clones. Foram construídos mapas de superfície para correlacionar os genes com as bibliotecas dos diferentes tecidos. Foram encontradas correlações positivas ou neutras entre os genes em uma mesma biblioteca. Os genes relacionados à síntese de celulose (família CesA) foram os de maior expressão na planta, embora a maior expressão esteja associada à raiz e colmo. Entre as hidrolases, beta-1,3-glucanases, xiloglucano endo-beta-transglicosilase, beta-glucosidase e endo-beta-mananase foram os genes com o maior número de clones. Análise de correlação (por mapas de superfície) revelou que a expressão dos genes relacionados à biossíntese parece estar associada à hidrólise de hemicelulose, enquanto as hidrolases de pectina estão relacionadas principalmente às hidrolases de xiloglucano. O padrão de expressão de genes relacionados à parede celular, baseado no número de "reads" por "cluster" refletiu bem as características fisiológicas esperadas para cada tecido. Este é o primeiro trabalho que fornece uma visão geral do metabolismo de parede celular através da expressão dos genes em vários tecidos ao mesmo tempo. Por exemplo, inflorescências em desenvolvimento se comportaram de forma semelhante a tecidos meristemáticos e à região de transição folha-raiz. Estes dados servirão tanto para pesquisas em fisiologia e desenvolvimento de cana, como também para o desenvolvimento de processos industriais.

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