Nucleotide sequence comparison of the capsid Protein gene of severe and protective mild strains of Papaya ringspot virus

AUTOR(ES)

Della Vecchia, Marilia G. S., Camargo, Luis E. A., Rezende, Jorge A. M.

FONTE

Fitopatologia Brasileira

DATA DE PUBLICAÇÃO

2003-12

RESUMO

Nesse estudo foram comparadas três estirpes premunizantes e duas estirpes severas do Papaya ringspot virus - type W, com base na seqüência de nucleotídeos do gene da proteína capsidial. As seqüências das proteínas do capsídeo das estirpes premunizantes compartilharam identidades de 98-100%. Quando comparadas às estirpes severas, a identidade variou de 93% a 95%. PRSV-W-2R, uma estirpe severa, resultante da reversão da estirpe PRSV-W-2, mostrou 100% de identidade com a seqüência da proteína do capsídio da estirpe parental PRSV-W-2. Uma inserção de seis nucleotídeos na região conservada da proteína do capsídeo, que resultou na adição de dois aminoácidos (Asn e Asp) na seqüência deduzida da proteína foi encontrada em todas as estirpes premunizantes. A comparação destas seqüências foi utilizada para desenhar oligonucleotídeos iniciadores próprios da espécie que foram usados para amplificar essas regiões nas estirpes severas e premunizantes

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