Método para melhoria da eficiência na identificação computacional de RNAs não-codificantes / Method to obtain a more efficient tool that compares a non-coding RNA sequence against a sequence database
AUTOR(ES)
Cristina Teixeira de Oliveira
DATA DE PUBLICAÇÃO
2009
RESUMO
Até pouco tempo acreditava-se que a maioria das moléculas de RNA estava relacionada à tradução de proteínas. Porém, descobriu-se que outros tipos de moléculas de RNA que não são traduzidas estão presentes em muitos organismos diferentes e afetam uma variedade de processos moleculares, são os chamados RNAs não-codificantes (ncRNAs). Apesar de sua importância funcional, os métodos biológicos e computacionais para a detecção e caracterização de RNAs não-codificantes ainda são imprecisos e incompletos. A identificação de novas espécies de ncRNAs é difícil através de procedimentos experimentais e as técnicas computacionais existentes são lentas. O objetivo deste trabalho foi obter uma ferramenta mais eficiente para a comparação de uma seqüência de RNA não-codificante contra um banco de seqüências. Para isso foi proposto e implementado um modelo para identificação computacional de ncRNAs com apoio dos pacote Viena e Infernal e foram realizados experimentos para avaliá-lo
ASSUNTO(S)
bioinformática noncoding rnas viena infernal infernal bioinformatics viena rnas não-codificantes
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