Metagenômica comparativa de solo de regiões de mata atlântica e caatinga do estado do Rio Grande do Norte - Brasil
AUTOR(ES)
Ralfo Goes Pacchioni
FONTE
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia
DATA DE PUBLICAÇÃO
02/12/2010
RESUMO
Os microorganismos desempenham importantes funções na manutenção dos ecossistemas, o que explica o enorme interesse em compreender as relações existentes entre estes organismos, bem como entre eles e o meio. Estima-se que o número total de células procarióticas na Terra seja entre 4 e 6 x 1030, constituindo um enorme pool biológico e genético a ser explorado. Apesar de atualmente apenas 1% de toda essa riqueza poder ser cultivada por técnicas laboratoriais padrão, ferramentas metagenômicas permitem o acesso ao potencial genômico de amostras ambientais de forma independente de cultivo, e em associação com tecnologias de sequenciamento da terceira geração, a cobertura amostral se torna ainda maior. Solos, em particular, são os maiores reservatórios dessa diversidade, e muitos ambientes importantes ao nosso redor, como os biomas brasileiros Caatinga e Mata Atlântica, são pouco estudados. Sendo assim, o material genético ambiental de amostras de solo dos biomas Caatinga e Mata Atlântica foi extraído através de técnicas diretas, pirosequenciado, e as seqüências geradas foram analisadas através de programas de bioinformática (MEGAN, MG-RAST e WEBCarma). Perfis taxonômicos comparativos das amostras mostraram que os filos Proteobacteria, Actinobacteria, Acidobacteria e Planctomycetes foram os mais representativos. Em adição, fungos do filo Ascomycota foram identificados predominantemente na amostra de solo de Mata Atlântica. Perfis metabólicos mostraram que, apesar da existência de diferenças ambientais, sequências de ambas as amostras foram inseridas similarmente nos diversos subsistemas funcionais, não indicando funções habitat específicas. Este trabalho, pioneiro em análises taxonômicas e metabólicas comparativas de amostras de solo de biomas brasileiros, contribui para o conhecimento destes sistemas ambientais complexos, até então pouco explorados
ASSUNTO(S)
metagenoma solo pirosequenciamento megan carma mg-rast caatinga mata atlântica bioquimica metagenome soil pyrosequencing megan carma mg-rast caatinga atlantic forest
ACESSO AO ARTIGO
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