Marcadores moleculares microssatélites na investigação do genoma de Drosophila mediopunctata : desenvolvimento e construção de mapa genético de ligação / Microsatellite markers in the investigation of Drosophila mediopunctata genome : development and genetic linkage map construction

AUTOR(ES)

Prianda Rios Laborda

FONTE

IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia

DATA DE PUBLICAÇÃO

25/05/2011

RESUMO

Drosophila mediopunctata, mosca não cosmopolita de distribuição neotropical e pertencente ao grupo tripunctata do subgênero Drosophila, é uma espécie utilizada por alguns grupos no Brasil como modelo em estudos com enfoque evolutivo. Abordagens que exploram a biologia da espécie, tais como a detecção de variação genética natural e a influência de inversões cromossômicas na dinâmica populacional são costumeiramente usadas. Todavia, essa espécie não possui disponíveis marcadores moleculares que facilitem a investigação das bases genéticas que norteiam os eventos explorados até agora. Os microssatélites são marcadores moleculares consagrados e a ferramenta de escolha no estudo de diversos organismos pela simplicidade de uso e de análise. Entretanto, para espécies que ainda não têm grande parte de seu genoma seqüenciado, a obtenção de marcadores desse tipo passa pela necessidade de desenvolvimento via bibliotecas genômicas. Esse trabalho objetivou desenvolver, caracterizar e mapear microssatélites em D. mediopunctata para que estudos de variação morfológica, de identificação de regiões genômicas associadas a fenótipos de interesse, de genética de populações entre outros possam ser realizados com o respaldo de dados moleculares. Uma biblioteca enriquecida em motivos repetitivos foi construída e, após o seqüenciamento de aproximadamente 2000 clones, 600 microssatélites foram identificados e 134 locos desenvolvidos. Os marcadores mostraram tamanho reduzido com relação ao número de repetições e preponderância de motivos AC/GT. A aplicação dos microssatélites de D. mediopunctata para amplificações heterólogas em outras trinta espécies foi feita com aproximadamente 50% de sucesso. Em adição, o uso de dados de presença/ausência nas espécies do grupo tripunctata recuperou algumas relações filogenéticas previamente conhecidas. Um mapa de ligação foi construído com 49 marcadores e revelou 450 cM de extensão. Os cinco principais cromossomos da espécie foram identificados por meio de comparações com o genoma de D. melanogaster e com os elementos de Müller. Essas comparações também confirmaram a grande sintenia prevista dentro do gênero Drosophila. Não houve concordância na ordem dos locos microssatélites nas duas espécies. No cromossomo II de D. mediopunctata foi mapeada uma região associada à característica "número de pintas abdominais"

ASSUNTO(S)

drosofila microssatélites (genética) mapeamento cromossômico drosophila microsatellites (genetics) chromosome mapping

Documentos Relacionados

• Construção de um mapa de ligação para espécies silvestres de Arachis, possuidoras de genoma BB, por meio de marcadores microssatélites.
• Desenvolvimento de marcadores moleculares microssatelites, mapeamento genetico e mapeamento de caracteristicas qualitativas em feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.)
• Construção do mapa genético preliminar do peixe Prochilodus argenteus, utilizando marcadores microssatélites
• Construção de um mapa genético de uma população de Capsicum annuum utilizando marcadores microssatélites.
• Construção de um mapa genético de uma população de Capsicum annuum utilizando marcadores microssatélites.