LabSystem Gen, um gerador de sistemas gerenciadores de informações laboratoriais para coleta e análise de dados genéticos. / LabSystem Gen, a generator of laboratory information management systems for collecting and analyzing genetic data.

AUTOR(ES)
FONTE

IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia

DATA DE PUBLICAÇÃO

02/07/2010

RESUMO

Análise de dados biológicos envolve consultas em portais web cujos parâmetros de busca são dados armazenados em repositórios de dados laboratoriais. Na perspectiva de facilitar essas análises, uma solução é estruturar os dados biológicos em bancos de dados relacionais e utilizar ferramentas informatizadas capazes de cruzá-los com informações disponíveis na web. Para tanto, foi desenvolvida uma ferramenta O LabSystem Gen, capaz de criar um Sistema Gerenciador de Informações Laboratoriais (SGIL) integrado a bancos de dados públicos na web. A ferramenta permite que pesquisadores com pouco ou nenhum conhecimento em linguagens de programação de computadores criem um SGIL capaz de armazenar, gerenciar, analisar e integrar dados laboratoriais. Para comprovar as funcionalidades do LabSystem Gen, foi implementado o programa xHLA e a eDAframework. O xHLA cruza automaticamente informações laboratoriais com dados de domínio público com o objetivo de automatizar e facilitar o estudo pré e pós transplante de pares doador-receptor, cujos receptores são pacientes hipersensibilizados. A eDAframework integra o programa xHLA, os dados armazenados em um SGIL, os dados gerados por equipamentos laboratoriais e os dados disponíveis em repositórios públicos de dados biológicos. Essa integração permite que análises complexas possam ser realizadas de forma automática e simples.

ASSUNTO(S)

transplante de tecido histocompatibilidade dados biológicos análise de dados automação ciencia da computacao tissue transplantation histocompatibility biological data data analysis automation

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