Identification, classification and expression pattern analysis of sugarcane cysteine proteinases

AUTOR(ES)
FONTE

Genetics and Molecular Biology

DATA DE PUBLICAÇÃO

2001-12

RESUMO

Proteinases cisteínicas são peptidil-hidrolases dependentes de um resíduo de cisteína em seu sítio ativo. As propriedades físico-químicas destas proteinases têm sido amplamente caracterizadas, entretanto suas funções biológicas ainda não foram completamente elucidadas. Elas estão envolvidas em um grande número de eventos, tais como: processamento e degradação protéica, câncer, germinação, morte celular programada e processos de senescência. Diferentes proteinases cisteínicas, classificadas pelo Comitê de Nomenclatura da União Internacional de Bioquímica e Biologia Molecular (IUBMB) como pertencentes à sub-sub-classe E.C.3.4.22, foram usadas na busca de clusters no banco de dados do SUCEST (SUgarCane EST project), utilizando-s o programa T-BLAST-n. Homologia de seqüências foram encontradas com 76 clusters que correspondem a prováveis proteinases cisteínicas. O alinhamento destas seqüências com a de outras proteases cisteínicas, de diversas origens, forneceu informação quanto à classificação e possível função das proteinases de cana-de-açúcar. Além disso, o padrão de expressão de cada gene foi postulado a partir da correlação direta com as bibliotecas de cDNA do SUCEST dos quais os clusters foram derivados. Uma vez que nenhum gene de protease cisteínica foi anteriormente evidenciado em cana-de-açúcar, este estudo representa uma etapa inicial para o estudo de novos aspectos bioquímicos, fisiológicos e biotecnológicos destas enzimas.

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