Evaluation of protein extraction methods for enhanced proteomic analysis of tomato leaves and roots

AUTOR(ES)

VILHENA, MILCA B., FRANCO, MÔNICA R., SCHMIDT, DAIANA, CARVALHO, GISELLE, AZEVEDO, RICARDO A.

FONTE

An. Acad. Bras. Ciênc.

DATA DE PUBLICAÇÃO

25/08/2015

RESUMO

A proteômica é uma área incrível da ciência cujas apli cações vêm avançando para diversos propósitos. Um aspecto crucial para se alcançar boa resolução proteômica é o estabelecimento de uma metodologia que resulte na melhor qualidade e ampla representação das proteínas totais. Outro aspecto importante é que em muitos estudos quantidades limitadas de tecido e de proteínas totais no tecido a ser estudado são encontradas, tornando difícil a análise. Com o objetivo de testar diferentes parâmetros, combinações usando mínimas quantidades de tecido com 4 protocolos para extração protéica de folhas e raízes de tomateiro (Solanum lycopersicumL.) foram avaliadas com atenção especial para a capacidade de remover interferentes e atingir resolução adequada em eletroforese bidimensional, bem como rendimento satisfatório de proteínas. A avaliação dos protocolos de extração revelou grandes diferenças na quantidade de proteínas obtidas por cada um. O protocolo TCA/acetona mostrou ser o protocolo mais eficiente, que permitiu a detecção de 211 "spots" para folhas e 336 para raízes utilizando 500 µg de proteína de folhas e 800 µg de proteínas de raiz por gel.

ASSUNTO(S)

eletroforese bidimensional proteínas otimização de protocolo tomateiro

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