Estudo de processos para modelagem, avaliaÃÃo, alteraÃÃo e seleÃÃo de estruturas de proteÃnas

AUTOR(ES)
DATA DE PUBLICAÇÃO

2005

RESUMO

O projeto consiste no estudo de diversos sistemas aplicados no processo de construÃÃo de modelos de estruturas terciÃrias de proteÃnas, considerando etapas de modelagem e avaliaÃÃo da estrutura, assim como mecanismos para a modificaÃÃo visando a melhora das conformaÃÃes desenvolvidas. Ao longo desse estudo foi tambÃm desenvolvido um conjunto de interfaces que permite a comunicaÃÃo entre os diversos tipos de programas utilizados nas etapas citadas acima. AlÃm disso, um mÃtodo para a alteraÃÃo e melhora de pequenas regiÃes de um modelo da proteÃna foi implementado e adicionado no fluxo do processo de modelagem. Por fim, o algoritmo de construÃÃo de novas conformaÃÃes foi avaliado em delagem por homologia, criadas pela ferramenta MODELLER, sempre apresentado uma melhora nas regiÃes modificadas, enquanto elas apresentassem uma distÃncia superior a 1,7 Ã da estrutura nativa

ASSUNTO(S)

ciÃncia da computaÃÃo - bioinformÃtica ciencia da computacao modelagem de proteÃnas - otimizaÃÃo de estruturas - metodologia ab initio modelagem - anÃlis estrutural -aplicaÃÃo na bioquÃmica

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