Detection and nucleocapisid gene variability of Orchid fleck virus isolates from different geographic origns / Detecção e variabilidade do gene do nucleocapsídeo de isolados de diferentes regiões geográficas do vírus da mancha das orquídeas ("Orchid fleck virus"- OFV)

AUTOR(ES)

Karen Sumire Kubo

DATA DE PUBLICAÇÃO

2006

RESUMO

O vírus da mancha das orquídeas (“Orchid fleck virus” - OFV), transmitido pelo ácaro Brevipalpus californicus, causa manchas cloróticas e necróticas em orquídeas de vários gêneros e foi relatado em diversos países. O diagnóstico de "orchid fleck", doença causada pelo OFV, tem sido feito através da análise dos sintomas, sorologia, observação de cortes ultrafinos de tecido infectado em microscópio eletrônico de transmissão ou RT-PCR. No entanto, apesar de testes moleculares serem freqüentemente mais eficientes e específicos que outros métodos, os "primers" disponíveis na literatura nem sempre detectam o vírus em baixas concentrações no tecido vegetal, ou amplificam regiões da planta sadia. Com base nas seqüências nucleotídicas da capa protéica viral depositadas no GenBank foram desenhados novos “primers”, que amplificam um fragmento de 326 pb. Esses “primers” foram utilizados para a detecção do OFV por RT-PCR e para a marcação com digoxigenina de sondas para hibridização. A variabilidade de um fragmento do gene da capa protéica deste vírus foi estudada por polimorfismo conformacional de fita simples ("Single strand conformational polymorphism" – SSCP) e seqüenciamento de nucleotídeos. Quarenta e oito amostras de 18 gêneros de orquídeas foram coletadas no Brasil, Costa Rica e Austrália. As análises dos padrões de SSCP resultaram em seis haplótipos diferentes e em agrupamentos baseados na origem geográfica das amostras. Amostras representando cada um desses padrões foram seqüenciadas e comparadas com aquelas disponíveis no GenBank. A análise de SSCP provou ser eficiente para fornecer informações preliminares sobre a variabilidade do OFV. No entanto, apenas através do seqüenciamento de nucleotídeos das amostras foi possível determinar a real variabilidade das mesmas.

ASSUNTO(S)

acari btv orchids brevipalpus californicus mancha anelar ochid fleck virus variação genética em plantas vetores de doenças de plantas vírus de plantas genetic variability orquídea

Documentos Relacionados

• Variability among Phaeoisariopsis griseola isolates
• Genotipic variability study of Rhipicephalus sanguineus (Latreille, 1806) (Acari, Ixodidae) from different geografic regions of Brazil.
• Variabilidade genética de etnovariedades de mandioca em regiões geográficas do Brasil
• Physiological variability of Cercospora coffeicola isolates
• Variabilidade de regiões gênicas e espaçadoras do DNA ribossomal de Verticillium dahliae isolados de hospedeiros diferentes