Desenvolvimento de ferramentas de bioinformática para análises de expressão gênica em larga escala / Development of bioinformatics tools for large-scale gene expression analysis

AUTOR(ES)
FONTE

IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia

DATA DE PUBLICAÇÃO

22/07/2011

RESUMO

A construção de perfis de expressão usando microarrays tornou-se um método amplamente utilizado para o estudo dos padrões de expressão gênica. Estes estudos produzem uma grande quantidade de dados que faz com que a análise seja complexa e demorada. À medida que a qualidade dos arrays se torna mais confiável com a introdução dos arrays industriais, a quantidade de dados gerados aumenta e o ponto crítico dos experimentos, passa a ser garantir uma boa análise de bioinformática. Para facilitar esta análise desenvolvemos um pipeline que executa todos os passos de processamento de dados, tais como a correção de background, controle de qualidade, normalização, detecção de genes diferencialmente expressos e análises de clusterização. Além disso, nossa ferramenta permite a escolha de diversos testes estatísticos paramétricos e não paramétricos e também faz mineração de dados, buscando as informações relevantes dos genes e gerando links para diversos bancos de dados públicos. A função principal desta ferramenta é auxiliar pesquisadores que trabalham com microarrays, pois ela facilita a análise da grande quantidade de dados que este tipo de experimento gera, podendo fornecer uma análise personalizada com a escolha dos testes estatísticos e valores de corte de acordo com os parâmetros que o usuário julgar mais apropriado para as condições de seu experimento. A facilidade de uso e aplicações múltiplas implementadas apresentadas nesta ferramenta são inéditas e esperamos contribuir de maneira significativa para estimular e facilitar o uso dos estudos de expressão em larga escala

ASSUNTO(S)

tubulações genética software pipelines genetics software

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