Avaliação de metodologias para mapeamento de caracterísyicas oligogênicas (OTL) em Linhagens Endogâmicas Recombinantes (RILs)

AUTOR(ES)
FONTE

Acta Sci., Agron.

DATA DE PUBLICAÇÃO

2014-03

RESUMO

O presente trabalho teve como objetivo comparar a eficiência do Método de Mapeamento de características Oligogênicas (OTMM) e Método por Intervalo (IM) para a detecção de locos de características oligogênica (OTL) em linhagens endogâmicas recombinantes (RILs) de diferentes tamanhos. Foram utilizadas populações constituídas por 200, 500 e 1000 indivíduos e utilizou-se 100 repetições para cada tamanho da população. Quatro características foram avaliadas: C1, determinada por dois genes com 50 e 30% de efeitos sobre a expressão da característica; C2, governada por três genes, com 50, 20 e 10% de efeitos; C3, regulada por dois genes, cada um com 40% de efeito, e C4, controlada por dois genes, cada um com efeito de 50%. O IM foi eficiente na detecção de OTL em todas as características avaliadas, no entanto, para as características determinadas por dois genes com efeitos entre 40 e 50%, o OTMM foi mais eficiente na detecção e localização de OTL das marcas simuladas. O método de MI foi mais eficiente na detecção e localização de OTL nas marcas simulados, quando o efeito do gene variaram de 10 a 30%. Como as características oligogênica são governados por genes com maiores efeitos, a OTMM foi considerado o método mais eficiente para ser usado para este tipo de característica.

ASSUNTO(S)

estatística genômica epistasia melhoramento genético

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