Análise da expressão gênica em pacientes talassêmicos homozigotos para mutação beta 39 com evoluções clìnicas distintas, maior e intermediária, por Serial Analysis of Gene Expression (SAGE) / Analysis of gene expression from patients with beta thalassemia, carrying the same mutation (Cd39) but with different phenotypes (major and intermedia), using the Serial Analysis of Gene Expression (SAGE)

AUTOR(ES)
DATA DE PUBLICAÇÃO

2010

RESUMO

As síndromes talassêmicas compreendem um grupo heterogêneo de doenças hereditárias em que existe uma redução no ritmo de síntese de uma ou mais cadeias polipeptídicas da hemoglobina. Nas talassemias ß ocorre a supressão total ou parcial da produção de cadeias ß. O estado homozigótico da maioria das variantes genéticas da talassemia ß produz o quadro clínico da talassemia maior. Esses pacientes apresentam acentuada anemia e necessitam de transfusões sanguíneas regulares para sobreviverem. Os indivíduos heterozigotos para a talassemia ß apresentam, com raras exceções, apenas discreta anemia. Existem ainda alguns quadros clínicos não tão graves quanto à forma homozigótica clássica, geralmente não dependem de transfusões, que são denominados de talassemia intermediária. Os genes responsáveis pela síntese das cadeias da ß globina estão organizados em um cluster localizado no braço curto do cromossomo 11. Quase 200 alelos de talassemia ß já foram caracaterizados. Destes, 125 representam mutações pontuais em regiões funcionalmente importantes do gene, uma de particular interesse ao nosso estudo, é a mutação Cd 39 (C--T). Este trabalho teve como objetivo analisar o perfil global de expressão gênica de células CD 34+ de pacientes com talassemia ß, portadores da mesma mutação genética (Cd 39), mas com evoluções clínicas distintas, maior e intermediária, pelo método de SAGE (Serial Analysis of Gene Expression). Foram gerados 2718 trancritos únicos para o perfil de talassemia ß intermediária e 3052 para o perfil de talassemia ß maior, os quais foram classificados como genes identifcados, no matches, ESTs e outras sequências preditas e anotadas. As expressões de 14 genes foram quantificadas pela reação em cadeia da polimerase em tempo real nas amostras de células CD34+ dos pacientes talassêmicos intermediário e maior, com intuito de validar os resultados obtidos pelo SAGE. As expressões foram concordantes em 57,14% dos genes (ABCB10, APEX1, APOC1, EYA3, HMBS, OAZ1, SRGN, TAGLN2) e discordantes nos demais 42,85% (EIF5a, GRIN2C, HMGB1, NAE1, PCBP2, RAD23B). Quando ambos os perfis foram comparados entre si, 42 transcritos foram ditos como diferencialmente expresso (p<0,05). A análise funcional comparativa dos 42 transcritos diferencialmente expressos foi realizada de acordo com o Gene Ontology Consortium afim de obtermos a classificação funcional destes transcritos. Em conjunto, os resultados podem colaborar na identificação de transcritos importantes, que possam auxiliar na melhor compreensão da fisiopatologia desta doença e desempenhar papéis moduladores no fenótipo em talassemia ß

ASSUNTO(S)

talassemia beta analise serial da expressão genica beta thalassemia sage

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