AMPLIFICATION AND SELECTION PROFILE OF ISSR MARKERS FOR GENETIC STUDIES IN Calotropis procera
AUTOR(ES)
DIAS, CIBELLE SANTOS; SANTOS, LUIZ HENRIQUE TOLENTINO; MEIRA, MESSULAN RODRIGUES; SANTOS, ELISA SUSILENE LISBOA DOS; CERQUEIRA-SILVA, CARLOS BERNARD MORENO
FONTE
Revista Caatinga
DATA DE PUBLICAÇÃO
2022
RESUMO
RESUMO Algodão de seda é uma espécie vegetal adaptada a vários ecossistemas e tem se destacado pela importância econômica e ecológica. Nós avaliamos o perfil de amplificação de 23 iniciadores ISSR e selecionamos loci polimórficos para estudos genéticos de uma população natural de Calotropis procera por meio da coleta e extração de DNA genômico de 33 indivíduos. O DNA genômico foi extraído usando o protocolo sorbitol e CTAB 2% e os produtos de amplificação ISSR foram resolvidos por eletroforese. Com base no perfil de amplificação, os 23 iniciadores foram classificados como adequados, razoáveis e inadequados. Descrevemos a qualidade dos iniciadores considerando o número total de bandas, média das bandas por iniciador, porcentagem de polimorfismo, diversidade genética de Nei (heterozigosidade esperada - He), assumindo o equilíbrio de Hardy-Weinberg e conteúdo das informações polimórficas (PIC). Todos os iniciadores ISSR apresentaram perfil de amplificação, os quais geraram 173 marcas com média de 7,5 loci por iniciador. Porém, dos 23 iniciadores testados, apenas 18 permitiram amplificação visível e de alta qualidade, que foram classificados como adequado e polimórfico. Também observamos média de 0,30 e 0,24 para as estimativas de PIC e He, respectivamente. Os iniciadores DiCA3`RG, TriAGA3`RC e TriCGC3`RC foram altamente transferíveis para C. procera (apresentaram qualidade para amplificação com boa reprodutibilidade), com valores de PIC superiores a 0,40, He superior a 0,30 e polimorfismo superior a 86%.
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