A rearrangement-based approach to compare whole genomes of Vibrionacea strains / Comparação de genomas completos de especies da familia Vibrionacea empregando rearranjo de genomas
AUTOR(ES)
Patricia Pilisson Cogo
DATA DE PUBLICAÇÃO
2007
RESUMO
A evolução das técnicas de seqüenciamento tornou possível a obtenção de uma enorme quantidade de dados genômicos. O desafio atual é analisar esses dados e construir novos conhecimentos a partir deles. Neste contexto, um problema importante e ainda em aberto é a criação de métodos de análise taxonômica de genomas completos. Especialmente para organismos procariontes, para os quais ainda não há um conceito claro de espécie, a comparação de genomas completos pode significar uma importante contribuição. Neste trabalho propomos uma metodologia para comparação de genomas completos baseada na teoria de Rearranjo de Genomas, aplicando-a a organismos da família Vibrionaceae ? uma família heterogênea que compreende organismos de cinco diferentes gêneros, incluindo o vibrião causador da cólera, uma doença grave e que ainda causa anualmente milhares de mortes em países em desenvolvimento. As distâncias genômicas obtidas quando analisamos separadamente cada um dos dois cromossomos que compõem o genoma desses organismos estão de acordo com as árvores filogenéticas construídas empregando outros métodos de comparação genômica. Esse resultado corrobora nosso método e a utilização da teoria de rearranjo de genomas como uma alternativa para análise de genomas completos. Além disso, pode indicar que os eventos modelados neste trabalho, como perda de genes, transferências horizontais, reversões entre outros, exercem um papel importante na evolução desses organismos. Compreender a dinâmica desses eventos e combiná-la a outros métodos de análise genômica pode significar um grande avanço para a construção de uma filogenia mais acurada para estes vibriões
ASSUNTO(S)
genomica genomics computational biology filogenia phylogeny biologia computacional
