A new clustering algorithm for tridimensional gene expression data / Um novo algoritmo de clustering para a organização tridimensional de dados de expressão gênica

AUTOR(ES)

Tiago José da Silva Lopes

DATA DE PUBLICAÇÃO

2007

RESUMO

Neste trabalho desenvolvemos um novo algoritmo para clustering para dados de expressão gênica. As abordagens tradicionais utilizam um conjunto de dados na forma de uma tabela de duas dimensões, onde as linhas são os genes e as colunas são as condições experimentais. Nós utilizamos uma estrutura de três dimensões, acrescentando fatias de tempo. Implementamos nosso algoritmo e testamos com conjuntos de dados sintéticos e dados reais, usando índices de validação para comparar os resultados obtidos pelo nosso algoritmo com os resultados produzidos pelo algoritmo TriCluster. Os resultados mostraram que o nosso algoritmo é bom para dados de expressão gênica em três dimensões e pode ser aplicado a dados de outros domínios

ASSUNTO(S)

microarray bioinformática expressão gênica clustering bioinformatics microarray gene expression clustring

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