Alinhamento De Sequencias
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25. Filogenia molecular das abelhas Augochlorini (Hymenoptera, Apidae) / Molecular phylogeny of Augochlorini bees (Hymenoptera, Apidae)
Augochlorini (Halictinae) e um elemento comum na região Neotropical, e a historia natural das suas espécies e marcada pela plasticidade quando comparada a outras abelhas. A tribo e grupo-irmão de Halictini, e seus fosseis datam pelos menos do âmbar Dominicano (cerca de 20 milhões de anos). As relações entre os gêneros de Augochlorini foram reconstru�
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 23/05/2011
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26. Estudos sobre a estrutura e organização das extremidades cromossômicas de Trypanosoma cruzi com ferramentas de bioinformática, cromossomo artificial e radiação ionizante
Formas tripomastigotas de T. cruzi expressam glicoproteínas de superfície da superfamília das trans-sialidases (TS), implicadas nos processos de invasão da célula hospedeira. As TSs constituem uma grande família gênica codificando grande número de proteínas de superfície. Populações de T. cruzi podem expressar diferentes formas antigênicas de TS
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 25/03/2011
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27. PCR Multiplex para detecção dos principais herpesvírus neurológicos de ruminantes
Desenvolveu-se uma PCR multiplex (mPCR) para diagnóstico diferencial de encefalite bovina causada por herpesvírus suíno 1 (SuHV-1), herpesvírus bovino 1 (BoHV-1), herpesvírus bovino 5 (BoHV-5) e herpesvírus ovino 2 (OvHV-2). Os iniciadores foram projetados após alinhamento de sequências disponíveis no banco de genomas (GenBank) e a reação foi padr
Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia. Publicado em: 2011-12
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28. Identificação e caracterização de genes vip e cry coleóptero‑específicos em isolados de Bacillus thuringiensis
O objetivo deste trabalho foi identificar e caracterizar os genes cry3, vip1, vip2 e vip1/vip2 em uma coleção de 1.078 isolados de Bacillus thuringiensis potencialmente tóxicos para larvas de coleópteros. Foram utilizados pares de oligonucleotídeos iniciadores gerais obtidos a partir de regiões conservadas dos genes e do alinhamento de sequências cons
Pesquisa Agropecuária Brasileira. Publicado em: 2011-09
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29. Análise preliminar de um processo para identificação e alinhamento de seqüências homólogas para proteínas com estrutura resolvida.
O objetivo deste trabalho é apresentar e fazer uma avaliação preliminar de um processo alternativo, denominado Sequences Homologue to the Query (Structure-having) Sequence-SH2Q, para elaboração de alinhamentos múltiplos semelhantes à aqueles relatados no HSSP. O processo aqui apresentado baseia-se em programas de domínio público para busca em bases
Campinas: Embrapa Informática Agropecuária. Publicado em: 2011
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30. Identificação molecular e caracterização da diversidae de espécies de fungos micorrízicos arbusculares do gênero Gigaspora por PCR-DGGE (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis).
Metodologia. estirpes de fungos MA avaliadas. Amostras de solo. Extração e preparação de esporos para análise de DNA. Experimento teste de PCR para verificar a especificidade dos "primers" para a família Gigasporaceae. Experimento de casa-de-vegetação. Amplificação de DNA de esporos utilizando um PCR em "nested". PCR utilizando primers específicos
Seropédica: Embrapa Agrobiologia. Publicado em: 2011
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31. Estudo in silico da reatividade cruzada entre epitopos de hantavírus
Diariamente, o organismo humano é desafiado através da invasão de patógenos. No caso da invasão viral, o principal meio de defesa ocorre através do Receptor de Linfócito T (TCR), o qual interage com o peptídeo viral (epitopo) que é apresentado pelo Complexo Principal de Histocompatibilidade de classe I (MHC-I). Dada a imensidão de epitopos possíve
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 2011
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32. Filogeografia e variabilidade genética de Calibrachoa heterophylla (Sendtn.) Wijsman (Solanaceae)
O gênero Calibrachoa (Solanaceae) é tipicamente Sul-americano, atingiu o sudeste brasileiro através de uma provável rota migratória andino-pampeana. As espécies de Calibrachoa não possuem mecanismos de dispersão de sementes a longas distâncias nem qualquer estratégia de multiplicação vegetativa. Calibrachoa heterophylla é uma espécie que habita
Publicado em: 2011
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33. Análises sorológica e filogenéticas de amostras de herpesvírus bovino tipos 1 e 5 / Serological and phylogenetic analysis of bovine herpesvirus types 1 and 5 isolates
O presente estudo foi conduzido com o objetivo de determinar se a sensibilidade do teste de Soroneutralização (SN) seria afetada quando utilizados distintos subtipos de herpesvírus bovino tipos 1 (BoHV-1) e 5 (BoHV-5). Dessa forma, soros de bovinos, coletados randomicamente (n= 287) foram testados por SN frente a três amostras de BoHV-1 (BoHV-1.1: EVI123
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 2011
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34. Desenvolvimento de marcadores SSR, M-AFLP e SNP visando à integração de mapas genético-moleculares de Passiflora alata Curtis / Development of SSR, M-AFLP and SNP markers for linkage map integration of Passiflora alata Curtis
Embora não exista uma variedade comercial de maracujazeiro-doce (Passiflora alata Curtis), a fruta vem ganhando espaço no mercado brasileiro, justificando o uso de técnicas convencionais e moleculares no melhoramento da cultura. Nas espécies em que ocorre autoincompatibilidade e o cruzamento entre indivíduos é obrigatório, como nos maracujazeiros, nã
Publicado em: 2011
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35. Identificação de genes e o Problema do Alinhamento Spliced Múltiplo
The gene prediction in DNA sequences of eukariotic organisms is still an open problem in Bioinformatics. The sequence comparison based approach is commonly used in the search of solutions for this problem. Several different combinations of sequences are being used by gene recognition tools and in this work we propose the comparison of many cDNA sequences wit
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 14/12/2010
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36. Uso da álgebra linear para análise de similaridades e extração de padrões em sequências protéicas
Extrair padrões de dados de seqüências de proteínas é um dos desafios da Biologia Computacional. Neste trabalho, é apresentada uma metodologia que usa técnicas de Álgebra Linear, Estatística e Otimização para a análise de sequências primárias de proteínas. Inicialmente, cada sequência é transformada num vetor de frequências de peptídeos de
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 23/11/2010