Predicao De Estruturas De Proteinas
Mostrando 1-12 de 25 artigos, teses e dissertações.
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1. Gene floR e a resistência ao florfenicol em isolados de Aeromonas spp. autóctones de organismos aquáticos
RESUMO: O gene floR descrito é descrito pela literatura como o responsável pela resistência ao florfenicol, que é um antimicrobiano amplamente utilizado na aquicultura. Esse gene já foi relatado em muitas espécies de bactérias, inclusive no gênero Aeromonas. Essas bactérias causam alta mortalidade na piscicultura trazendo prejuízos econômicos. É
Pesq. Vet. Bras.. Publicado em: 2018-03
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2. Função de avaliação dinâmica em algoritmos genéticos aplicados na predição de estruturas tridimensionais de proteínas / Genetic Algorithms with Dynamic Fitness Functions Applied to Tridimensional Protein Structure Prediction
The protein structure prediction can be seen as an optimization problem where given an amino acid sequence, the tertiary protein structure must be found amongst many possible by obtaining energy functions minima. Many researchers have been proposing Evolutionary Computation strategies to find tridimensional structures of proteins; however results are not alw
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 28/09/2012
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3. Self-organization of population in Artificial Immune Systems applied to the protein docking / Auto-organização da população em sistemas imunológicos artificiais aplicada ao docking de proteínas
Vários problemas do mundo real podem ser analisados como problemas de otimização. Na bioinformática, em especial, como exemplos podem ser citados o alinhamento múltiplo de sequências, a filogenia, a predição de estruturas de proteínas e RNA, entre outros. As Meta-heurísticas Populacionais (MhP) são técnicas baseadas em interações de conjuntos d
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 17/07/2012
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4. Genes cuticulares diferencialmente expressos durante eventos da metamorfose de Apis mellifera / Microarray analysis of genes expressed in the context of Apis mellifera metamorphosis
A cutícula dos insetos é composta principalmente por uma variedade de proteínas que interagem com filamentos de quitina, um polímero de N-acetilglicosamina, para formar um envoltório rígido que protege e dá forma ao organismo. O crescimento dos insetos depende da renovação periódica da cutícula, que se desprende durante a apólise e é digerida en
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 06/07/2012
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5. Algoritmo evolutivo de muitos objetivos para predição ab initio de estrutura de proteínas / Multiobjective evolutionary algorithm with many tables to ab initio protein structure prediction
Este trabalho foca o desenvolvimento de algoritmos de otimização para o problema de PSP puramente ab initio. Algoritmos que melhor exploram o espaço de potencial de soluções podem, em geral, encontrar melhores soluções. Esses algoritmos podem beneficiar ambas abordagens de PSP, tanto o modelo ab initio quanto os baseados em conhecimento a priori. Pesq
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 10/05/2012
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6. Um estudo sobre a predição da estrutura 3D aproximada de proteínas utilizando o método CReF com refinamento
Um dos principais desafios da Bioinformática Estrutural é entender como a informação decodificada em uma sequência linear de aminoácidos, ou estrutura primária de uma proteína, possibilita a formação de sua estrutura tridimensional. Muitos algoritmos buscam propor soluções para o problema complexo da classe NP-completo. Dentre eles, está o méto
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 22/03/2012
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7. miRNAs em Schistosoma mansoni: biogênese, predição, validação e alvos potenciais / miRNAs em Schistosoma mansoni: biogênese, predição, validação e alvos potenciais
Os miRNAs constituem uma classe extensa de pequenos RNAs não codificadores de proteínas possuindo, em sua forma madura, de 20 a 24 nucleotídeos, cuja função principal é regular a expressão gênica. Seus precursores, denominados pré-miRNAs, têm como característica principal a formação de estruturas secundárias estáveis em forma de grampos (hairp
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 03/02/2012
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8. Algoritmos evolutivos e modelo HP para predição de estruturas de proteínas
Predição de estruturas de proteínas (PSP) é um problema computacionalmente complexo. Modelos simplificados da molécula proteica (como o Modelo HP) e o uso de Algoritmos Evolutivos (AEs) estão entre as principais técnicas investigadas para PSP. Entretanto, a avaliação de uma estrutura representada pelo Modelo HP considera apenas o número de contatos
Sba: Controle & Automação Sociedade Brasileira de Automatica. Publicado em: 2012-02
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9. Estudos bioquímicos, funcionais e estruturais da septina humana SEPT2: fatores que determinam a formação de agregados / Functional and structural studies of human SEPT2: determinant factors triggering the sefl-assembly into amyloid fibrils
As septinas fazem parte de uma família de proteínas de ligação ao nucleotídeo guanina. As septinas têm mostrado ter um papel importante na citocinese e outros processos celulares, incluindo a determinação da polaridade celular e reorganização do citoesqueleto. Todos os membros da família de septinas são compostos por três domínios: um N-termina
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 26/10/2011
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10. Uso de estratégias baseadas em conhecimento para algoritmos genéticos aplicados à predição de estruturas tridimensionais de proteínas / Knowledge-based Approach to Genetic Algorithms for the Protein Structure Prediction Problem
Proteínas desempenham uma grande variedade de funções biológicas. O conhecimento da estrutura tridimensional proteica pode ajudar no entendimento da função desempenhada. De acordo com a hipótese de Anfisen, a estrutura terciária nativa de uma proteína pode ser determinada a partir da informação contida na sequência primária, o que permitiria que
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 20/05/2011
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11. Uso de Data Mining na descoberta ou identificação de regras de enovelamento baseado em perfis de hidrofobicidade / Use of Data Mining in the discovery or identification of folding rules based on hydrophobicity profiles
As proteínas são moléculas complexas encontradas em células vivas. Elas possuem uma estrutura terciária (tridimensional) específica que determina sua função e é necessária para a ligação específica de substratos ou outros ligantes. A estrutura de uma proteína pode ser organizada em quatro níveis hierárquicos: estrutura primária (sequência d
IBICT - Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia. Publicado em: 24/03/2011
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12. Uma metodologia para seleção de parâmetros em modelos de classificação de proteínas.
Os principais desafios relacionados ao problema de classificação de enzimas em banco de dados de estruturas de proteínas são: 1) o ruído presente nos dados; 2) o grande número de variáveis; 3) o número não-balanceado de membros por classe. Para abordar esses desafios, apresenta-se uma metodologia para seleção de parâmetros, que combina recursos d
Campinas: Embrapa Informática Agropecuária. Publicado em: 2011