Purification and identification of metabolites produced by Bacillus cereus and B. subtilis active against Meloidogyne exigua, and their in silico interaction with a putative phosphoribosyltransferase fromM. incognita

AUTOR(ES)
FONTE

An. Acad. Bras. Ciênc.

DATA DE PUBLICAÇÃO

25/04/2014

RESUMO

Com o objetivo de contribuir para o desenvolvimento de produtos para o controle de Meloidogyne exigua, as bactérias Bacillus cereus e B. subtilis foram cultivadas em meio líquido de cultura para produzirem metabólitos ativos contra este nematoide parasita de plantas. Os fracionamentos dos extratos em diclorometano dos meios de cultura produziram uracila, 9H-purina e di-idrouracila. Todos os compostos foram ativos contra M. exigua, sendo o último o mais eficiente. Ele apresentou CL50 de 204 µg/mL contra o nematoide, enquanto uma CL50 de 260 µg/mL foi observada para o nematicida comercial carbofuran. Uma busca por complexos proteína-ligante nos quais o ligante fosse estruturalmente similar à di-idrouracila resultou na seleção de fosforibosiltransferases, cujas sequências foram utilizadas em uma busca in silico no genoma de M. incognita por sequência de aminoácidos semelhante. A sequência resultante foi modelada e di-idrouracila e 9H-purina foram inseridos nos sítios ativos desta provável fosforibosiltransferase, resultando em complexos proteína-ligante que foram submetidos a simulações por dinâmica molecular. Cálculos das energias livres de ligação destes complexos revelaram que a constante de dissociação de di-idrouracila e 9H-purina da enzima é da ordem de 8,3 x 10-7 e 1,6 x 10-6 M, respectivamente. Consequentemente, estas substâncias e a provável fosforibosiltransferase podem ser de grande utilidade para o desenvolvimento de novos produtos para o controle de M. exigua.

ASSUNTO(S)

9h-purina di-idrouracila modelagem molecular atividade nematicida nematoide das galhas uracila

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